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槟榔花果转录组数据组装及基因功能注释

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为了挖掘参与槟榔主要次生代谢产物生物合成与积累的关键酶基因,并明确其组织特异性,本研究以‘热研1号’槟榔雄花、雌花、种子、果肉为试验材料,用Illumina HiSeqTM 2000分别进行转录组测序,共获得265 505 184个Clean reads片段,组装后与Nr、KOG、KEGG、Swiss-Prot四大数据库进行比对,共有78 798个Unigenes被四大数据库注释,其中NR共注释35 467个Unigenes,对比后发现槟榔与油棕、海枣等具有一定的相似性;Swiss-prot共注释23 722个Unigenes;KOG共注释20 499个Unigenes,根据功能将槟榔转录组中的Unigene分为26类;KEGG共注释20 499个Unigenes,有10 009个Unigenes被四大数据库同时注释.槟榔转录组数据库的建立,可以有效地为解决槟榔次生代谢调控方面研究空白及活性成分合成和积累的代谢途径尚未明确的问题给予强大数据支持.该研究所得结果有助于槟榔药用成分的大量生产,为槟榔药用价值的开发利用提供依据.
Transcriptome Data Assembly and Gene Function Annotation of Areca catechu L.Flower and Fruit

代佳妮、陈曦、云一倩、王勇、于靖

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海南大学热带农林学院,海口,570228

海南师范大学生命科学学院,热带岛屿生态学教育部重点实验室,海口,571158

槟榔 转录组 基因功能

本研究由海南省自然科学基金

20168364资助

2019

分子植物育种
海南省生物工程协会

分子植物育种

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子:0.765
ISSN:1672-416X
年,卷(期):2019.17(6)
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