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Small RNA深度测序鉴定甘薯种质的甘薯曲叶病毒

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本研究利用Small RNA深度测序对长沙、永州、邵阳等地采集的甘薯种质资源病毒症状样品进行鉴定,发现样品中含有与甘薯曲叶病毒同源的系列.设计引物进行PCR扩增,鉴定出24个SPLCV-A C1基因片段序列,经NCBI-Blast比对,与10个不同株系SPLCV同源性达96％以上.为进一步获得SPLCV全长序列,设计背靠背引物,经PCR扩增、鉴定,获得3个SPLCV全长序列.系列进化分析显示,这3个SPLCV分离物聚为同一分支,其中SPLCV (76)序列大小2 774bp,与甘薯乔治亚曲叶病毒中国分离物、甘薯金脉病毒具有较高同源性;SPLCV (47)序列大小2 777 bp,与甘薯河南曲叶病毒分离物具有较高同源性;SPLCV (68)序列大小2 832 bp,与甘薯广西曲叶病毒分离物具有96％的同源性.以上同源系列与Small RNA测序显示结果相一致.本研究结果为甘薯病毒病防控提供理论依据.
Identification of Sweet Potato Leaf Curl Virus by Small RNA Deep Sequencing in Sweet Potato Germplasm

黄艳岚、张道微、董芳、张超凡、邹学校

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湖南农业大学园艺园林学院,长沙,410128

湖南省农业科学院作物研究所,长沙,410125

湖南省农业科学院,长沙,410125

Small RNA 深度测序 甘薯曲叶病毒 双生病毒 病毒鉴定

本研究由国家现代农业产业技术体系本研究由国家现代农业产业技术体系湖南省自然科学基金湖南省自然科学基金湖南省农业科技创新资金湖南省农业科技创新资金长沙市甘薯工程技术研究中心和湖南省甘薯工程技术研究中心

CARS-11-C-162016JJ60702017XC13KQ17010242018TP2032

2019

分子植物育种
海南省生物工程协会

分子植物育种

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子：0.765
ISSN：1672-416X
年,卷(期)：2019.17(11)
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