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狗头枣GSTU基因的克隆及其序列分析

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为探索红枣GSTU类基因在红枣抗逆中的分子作用机制,本研究以狗头枣枣树叶片的DNA为模板,根据枣GSTU基因的序列(HM345954.1)设计引物,采用PCR方法获得GSTU基因序列,并利用生物信息学手段对其所对应蛋白的结构域、功能域、理化特性、跨膜区、二级结构及亚细胞定位等进行分析.结果 表明:克隆到的DNA序列全长838 bp,具有2个外显子和1个内含子,内含子在292～460 bp碱基处,该序列与GenBank中枣的GSTU核苷酸序列和氨基酸序列的同源性分别为99.85％和100％,表明成功的克隆了狗头枣的GSTU基因.该序列编码222个氨基酸,分子量为25.268 kD,理论等电点(pI)为6.10;亲水性的平均数为-0.242,表明该蛋白是亲水性蛋白.二级结构主要以α-螺旋为主,其次是无规则卷曲,不存在信号肽,表明该蛋白可能为非分泌性蛋白,该蛋白可能位于内质网(膜)和质膜上.本研究获得的狗头枣GSTU基因在基因结构上含有1个内含子,在核酸序列及氨基酸序列上与GenBank中枣的GSTU基因同源性高,并对其理化性质、结构等进行了预测与分析,为进一步研究红枣抗逆分子机制提供理论基础,同时为红枣品种的选育提供理论支持.
Cloning and Sequence Analysis of GSTU Gene from Goutou Jujube

陈国梁、赵赞延、何亚蓉、张睿、常勇、陈宗礼

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延安大学生命科学学院,延安,716000

延安大学,陕西省红枣重点实验室,延安,716000

狗头枣 GSTU基因 基因克隆 序列分析

本研究由国家自然科学基金陕西省科技厅农业科技创新与攻关项目陕西省红枣重点实验室专项延安市农业攻关项目陕西省大学生创新训练计划项目延安大学校级科研项目

317510052016NY-1382003-2029904322017KN-061585YD2014-01共同资助

2020

分子植物育种
海南省生物工程协会

分子植物育种

CSTPCD北大核心
影响因子：0.765
ISSN：1672-416X
年,卷(期)：2020.18(2)
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