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香樟IDI基因克隆及表达分析

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为了克隆香樟异戊烯基焦磷酸异构酶(isopentenyl diphosphate isomerase,IDI)基因,并进行生物信息学分析,为香樟植物萜类化合物的生物合成研究提供基础.本研究以香樟植物为试样,在转录组测序数据的基础上设计引物,应用RT-PCR技术克隆香樟IDI基因,通过实时定量PCR方法检测IDI基因在香樟根、茎和叶中表达量,利用生物信息学方法对IDI基因编码的蛋白进行表征.结果 表明,香樟IDI基因长度868 bp,开放读码框(ORF)为708 bp,编码235个氨基酸,编码蛋白的分子量为27.04 kD,等电点为5.13,蛋白的二级序列结构主要为α-螺旋.经预测香樟IDI是一个定位于细胞质,不含信号肽的亲水性稳定蛋白,具有异戊烯基焦磷酸异构酶的特征结构域.系统进化树分析表明,香樟IDI与野生型马来西亚蕉的亲缘关系较近.实时定量PCR结果表明,IDI在香樟茎中的表达量高于根和叶.本研究成功从香樟中克隆了IDI基因并进行了表征分析,为深入研究香樟IDI基因在萜类合成中的功能提供帮助.
Cloning and Expression Analysis of IDI Gene from Cinnamomum camphora

刘伟、曹先爽、王进、张瑶瑶、王煜炜

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国际竹藤中心,国家林业局竹藤科学与技术重点实验室,北京,100102

香樟(Cinnamomum camphora (L.) Presl) 异戊烯基焦磷酸异构酶 基因克隆 生物信息学分析

本研究由国家林业局948项目“十二五”国家科技支撑计划项目

2014-4-332012BAD23B03共同资助

2020

分子植物育种
海南省生物工程协会

分子植物育种

CSTPCD北大核心
影响因子：0.765
ISSN：1672-416X
年,卷(期)：2020.18(8)
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