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银缕梅MADS-box家族基因PsuAP1的克隆、生物信息学表达分析

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本研究以珍稀濒危植物银缕梅为材料,利用同源克隆与RACE技术克隆得到一个APl-like基因的cDNA全长序列,命名为PsuAP1.利用生物信息学方法对它所编码的氨基酸序列进行分析,结果表明,该基因序列全长916 bp,开放阅读框长度为747 bp,编码248个氨基酸,分子质量约28.62 kD,理论等电点为9.84,是一种不稳定亲水蛋白.保守结构域分析表明该基因属于MADS-box家族基因;序列比对分析显示其氨基酸序列与连香树相似性最高,达78.57％,进化树聚类分析也表明PsuAP1与连香树的氨基酸亲缘关系最近.亚细胞定位分析显示该蛋白定位于细胞核.二级结构中同时含有α-螺旋、延伸链和无规则卷曲结构,分别占比47.18％、11.29％、41.53％.荧光实时定量PCR分析表明,PsuAP1基因在花及果实中均有大量表达,推测其与花的发育以及果实的成熟相关.psuAPl基因的克隆以及表达分析使银缕梅开花调控机理的研究取得了新的突破,为该基因功能的进一步深入研究提供了实验材料以及理论基础.
Cloning of MADS-box Gene PsuAP1 from Parrotia subaequalis and Bioinformatics Expression Analysis

陈云霞、薛晓明、南程慧、蒋敬、郭海涛

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南京森林警察学院,南京,210023

南京森林警察学院,野生动植物物证技术国家林业和草原局重点实验室,南京,210023

银缕梅(Parrotia subaequalis) MADS-box 基因克隆 序列分析 表达分析

江苏省高校优秀科技创新团队

2021

10.13271/j.mpb.019.000072

分子植物育种
海南省生物工程协会

分子植物育种

CSTPCD北大核心
影响因子：0.765
ISSN：1672-416X
年,卷(期)：2021.19(1)
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