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玉米TPP家族基因生物信息学及表达分析

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TPP是合成海藻糖的关键酶,广泛存在于各种植株中,可通过影响海藻糖的合成参与调控植株的抗逆体系.分析玉米中TPP家族基因的性质和进化有利于进一步为玉米在逆境中的产量品质提高的研究奠定基础.本研究利用拟南芥的9个TPP家族基因,结合BLAST、Pfam、ExPASy、 MEGA 6.0、MEME、TBtools等软件和网站,对玉米TPP家族成员的基因位置、基因结构、蛋白质理化性质、保守基序、系统进化和基因表达模式进行分析.结果 显示,根据B73的完整基因组数据,在玉米基因组中共鉴定了26个TPP基因,氨基酸数介于243和1 391之间,均为亲水性蛋白,且64.5％的成员属酸性蛋白.除第10号染色体外,玉米TPP家族基因在其余染色体上均有分布.鉴定了3个保守结构域,结合基因进化和基因结构分析,具有相同motif的基因在进化和基因结构上相对一致.根据基因启动子顺式作用元件分析,Zm TPP11可能与提高植株低温抗性有关,ZmTPP15可能与加速玉米机械损伤愈合有关.通过对玉米TPP基因表达模式分析,发现有5个TPP基因在各组织和发育时期均高表达,而共表达分析和GO富集分析显示与Zm TPPs共表达的基因主要参与应激反应、信号传导、发育过程和生物调节等生物过程.研究结果为进一步研究玉米对逆境胁迫的响应和生长发育提供参考.
Bioinformatics and Expression Analysis of TPP Family Genes in Maize

张颖、陈浩、管淑君、罗红兵、邓敏

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湖南农业大学农学院,长沙,410128

湖南省玉米工程技术研究中心,长沙,410128

玉米 TPP基因家族 抗逆性 生物信息学 表达分析

湖南农业大学科研启动基金和湖南农业大学科学基金青年项目

19QN15

2021

10.13271/j.mpb.019.002450

分子植物育种
海南省生物工程协会

分子植物育种

CSTPCD北大核心
影响因子：0.765
ISSN：1672-416X
年,卷(期)：2021.19(8)
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