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小麦bZIP家族转录因子的鉴定及其在盐胁迫条件下的表达分析

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bZIP(Basic region/leucine zippermotif)蛋白是真核生物中普遍存在的一类转录因子,对植物应答胁迫具有重要作用.为了鉴定bZIP家族转录因子基因是否参与小麦盐胁迫响应的调控过程,获得更多与盐胁迫相关的bZIP转录因子,本研究以'科农199'(KN199)为实验材料,利用Illumina HiSeq平台进行150 bp双端测序,从转录组水平检测了 bZIP家族转录因子基因在小麦盐胁迫条件下的差异表达情况.结果显示,每个处理的生物学重复之间的相关系数都在0.97以上,说明本实验中样品重复性较好,在处理不同时间点样品间的差异非常显著.根据中国春(Chinese spring,CS)参考基因组筛选到的156个小麦bZIP家族转录因子中,有14个bZIP转录因子位于5B染色体上;经盐处理1 h后,鉴定出14 544个差异表达基因(DEGs),包括49个bZIP转录因子基因;在处理6 h后,鉴定出25 546个DEGs,包括59个bZIP转录因子基因,并且bZIP转录因子基因在两组样品之间有35个共同的DEGs,其中有25个基因上调表达,10个基因下调表达.小麦响应盐胁迫bZIP转录因子基因进行聚类分析结果与基因表达差异的结果一致.研究发现不论是总的DEGs还是差异表达的bZIP转录因子基因的数目,均随着处理时间的延长而增加,推测这些基因可能参与调控小麦盐胁迫反应.
Identification of bZIP Family Transcription Factors of Wheat and Expression Analysis under Salt Stress

毕晨曦、杨宇昕、于月华、李丹萍、史峰、马亮、孔秀英、张立超、倪志勇

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新疆农业大学农学院,乌鲁木齐,830052

中国农业科学院作物科学研究所,北京,100081

石家庄市农林科学研究院,石家庄,050041

小麦 bZIP转录因子 转录组测序 盐胁迫

2020D14002313602642018Q0022018Q018XJ2019G171

2021

分子植物育种
海南省生物工程协会

分子植物育种

CSTPCD北大核心
影响因子:0.765
ISSN:1672-416X
年,卷(期):2021.19(15)
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