利用NCBI数据库数据,以绶草叶绿体matK序列和核基因ITS序列为主要研究对象,对绶草的遗传多样性及地理分布格局进行讨论分析,以期为绶草优良种质资源的遗传多样性评价提供有价值的参考.结果表明:绶草的matK序列比对后长度为512 bp,G+C含量32.4％,A+T含量67.7％,序列碱基组成具有明显的A/T偏好性,共检测到7个单倍型,总单倍型多样性Hd为0.644,总核苷酸多样性(π)为0.003 16.绶草的ITS序列比对后长度为441 bp,G+C含量55.3％,A+T含量44.8％,共检测到15个单倍型,总单倍型多样性 Hd 为0.877,总核苷酸多样性(π)为0.007 18,遗传分化系数 Gst＜Nst(Gst=0.39＜Nst=0.64;Gst=0.26＜Nst=0.50),说明绶草具有明显的谱系地理分布格局,基因流较低(Nm=0.14,Nm=0.25),失配分析的观测值曲线与期待值曲线都呈下降趋势并且呈现多峰,结合中性检测结果发现绶草物种居群保持稳定,没有发生过近期扩张现象.本研究得出印度、韩国、日本和歌县,中国喜马拉雅山脉地区遗传多样性较高,推测在第四纪冰期时绶草在印度、中国、朝鲜、日本等均可能存在冰期避难所.
万方数据
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