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基于转录组数据挖掘桑树bHLH转录因子家族

Mining bHLH Transcription Factor Family of Mulberry based on Transcrip-tome Data

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bHLH转录因子在植物生长发育调节、生物/非生物胁迫应答以及次生代谢过程中发挥着重要的调控作用,但有关桑树bHLH转录因子的报道还相对较少,这不利于开展相关方面的探索.本研究通过生物信息学技术鉴定到54个桑树bHLH转录因子,并对其保守序列、基因结构、蛋白进化和组织表达进行了分析.结果表明,桑树bHLH转录因子含有2个保守功能域,位于N端的碱性区域和C端的HLH区域.N端的碱性区域由12个氨基酸残基组成,其中第9位和第10位上的精氨酸具有较强的保守性;C端的HLH区域由45个氨基酸组成,第20和50位上的亮氨酸高度保守,可能与二聚体的形成有关.在基因结构方面,大部分转录因子均含有内含子结构,相位类型有23种,以0和0-0型为主,各有10个基因.从蛋白家族系统进化上看,桑树bHLH蛋白与同源性较近的拟南芥序列交错排布,被划分在4个大的进化组中.多数基因在桑树的根、皮、冬芽、雄花和叶片中均有表达,5个基因具有明显的组织特异性,但表达量较低.本研究为进一步开展桑树bHLH转录因子的功能研究提供了理论依据.

李季生、李娜、贾漫丽、王彬彬、范伟、夏爱华

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承德医学院蚕业研究所,河北省高校特产蚕桑应用技术研发中心,承德,067000

桑树 bHLH转录因子 生物信息学分析 组织表达 转录组

河北省科技厅项目河北省"三三三"人才工程项目河北省教育厅青年基金

20326336DA201903008QN2018118

2022

10.13271/j.mpb.020.001798

分子植物育种
海南省生物工程协会

分子植物育种

CSTPCD北大核心
影响因子：0.765
ISSN：1672-416X
年,卷(期)：2022.20(6)
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