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辣椒4CL基因家族成员的鉴定与生物信息学分析

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4-香豆酸:辅酶A连接酶(4-coumarate:CoA ligase,4CL)基因家族调控植物木质素代谢、参与类黄酮和其他次生代谢产物合成.为了解辣椒Ca4CL基因家族的分子特性及生物学功能.本研究基于辣椒的全基因组测序结果鉴定4CL基因家族,并进行生物信息学分析.结果共鉴定获得8条辣椒4CL基因,不均匀的分布于基于3、7、11和12号染色体,其中Ca4CL06和Ca4CL08未锚定;辣椒Ca4CL的外显子数目在5～6之间,基序分析结果保守;分析顺式作用元件发现,在辣椒Ca4CLs上游2 000 bp序列中存在多个响应元件,包括光、Me-JA、厌氧诱导、低温等响应元件.辣椒4CL基因家族表达分析发现Ca4CL01在根、茎、叶、果皮(开花期后25 d,绿果期,转色期,转色10 d)、胎座(转色期,转色5 d,转色10 d)中均无表达,其余Ca4CLs表达具有较强组织特异性,Ca4CL04在叶、根、果皮等时期高表达.本研究为进一步分析Ca4CLs基因在生长发育、胁迫等条件下的功能和相应的信号转导途径提供了理论依据.
Identification and Bioinformatics Analysis of the 4CL Gene Family Members in Pepper(Capsicum annuum)

何磊、严希、袁圆、余伟、李伟、赖卫、刘崇政、杨红

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贵州省辣椒研究所,贵阳,550009

贵州省生物研究所,贵阳,550009

贵州大学农学院,贵阳,550025

辣椒(Capsicum annuum) 4CL基因家族 生物信息学分析 木质素

黔农科院青年基金黔农科院青年基金国家自然科学基金

[2018]16号[2018]38号31760576

2022

10.13271/j.mpb.020.002478

分子植物育种
海南省生物工程协会

分子植物育种

CSTPCD北大核心
影响因子：0.765
ISSN：1672-416X
年,卷(期)：2022.20(8)
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