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菜心Dof基因克隆、生物信息学分析及表达分析

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Dof(DNA binding with one finger)是植物特有的转录因子,在调控植物生长发育和代谢过程中发挥着重要作用.为明确Dof具体的生物学功能,本研究以'油绿501'菜心为材料,采用同源克隆法获得了Dof全长序列,并对其编码蛋白结构、基因表达模式及其互作蛋白的调控网络进行分析.结果表明:菜心BcDof3;1基因全长624bp,编码207个氨基酸,其N-端含有保守的Dof锌指结构.系统进化树分析表明,BcDof3;1与白菜BrDof3;1和拟南芥AtDof2的同源关系较近.RT-qPCR结果表明,BcDof3;1在菜心根、茎、叶、花和种子中均有表达,尤其在叶和花中的表达水平最高;其表达水平受氮调控.互作蛋白网络分析表明,BcDof3;1可能通过中性转化酶、淀粉酶、酰胺酶等调控碳氮代谢.研究结果为深入研究Dof在菜心生长发育和碳氮代谢中提供了理论参考.
Cloning,Bioinformatics Analysis and Expression Analysis of Dof from Flowering Chinese Cabbage

朱云娜、蔡墩旭、郑开聪、邓浩坤、卢大兴、刘建国

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韶关学院英东生物与农业学院,韶关,512005

菜心 Dof转录因子 基因克隆 生物信息学分析 基因表达

广东省自然科学基金广东省教育厅项目韶关学院校级自然科学研究项目

2019A15150116802019KTSCX16499000452

2022

分子植物育种
海南省生物工程协会

分子植物育种

CSTPCD北大核心
影响因子:0.765
ISSN:1672-416X
年,卷(期):2022.20(13)
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