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白芨块根生长发育转录组分析

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本研究以1年生、2年生和3年生的白芨根为研究材料,通过BGISEQ-500高通量测序平台进行转录组测序,测序结果共获得76 552条Unigenes序列.与七大数据库相似性比对结果显示,得到注释的Unigenes共有52 219条,占所有Unigenes的68.12％.对3个不同年限的白芨根转录组数据进行比较分析,共发现37 825条差异基因,涉及了 47种生物功能,可划分为分子功能、细胞组分和生物学过程三大类.通过KEGG富集分析发现共涉及134条信号通路,主要的信号通路为代谢通路和次生代谢产物合成通路.共有59条关键酶差异基因参与了甘露糖的合成途径,多条途径参与了葡萄糖的合成;12条根膨大相关的差异基因参与了白芨根的膨大生长调控.RT-qPCR分析验证了与根膨大和糖代谢相关的6个具有代表性的基因表达与转录组结果趋于一致.本研究结果为进一步深入研究白芨根生长发育和活性成分的生物合成的分子调控机制提供理论依据.
Transcriptome Analysis of Bletilla striata Root Growth and Development

齐家森、吴远双、李一果、徐慧妮、李昆志

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昆明理工大学生命科学与技术学院,昆明,650000

白芨(Bletilla striata) 转录组 差异基因 代谢途径 葡甘聚糖

国家自然科学基金国家自然科学基金

3176034931960071

2022

10.13271/j.mpb.020.004990

分子植物育种
海南省生物工程协会

分子植物育种

CSTPCD北大核心
影响因子：0.765
ISSN：1672-416X
年,卷(期)：2022.20(15)
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