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油棕TCP转录因子家族生物信息学鉴定及基因表达分析

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TCP基因作为植物所特有的转录因子家族,广泛参与调控植物的生长发育、代谢、信号转导、生理生化刺激响应及逆境应答等多个生物学过程.本研究利用生物信息学研究方法鉴定获得28个油棕TCP基因家族成员,并对其染色体定位、结构特点、motif、聚类分析及组织表达特异性进行分析.结果表明:共有27个基因在油棕的14条染色体上呈不均匀分布;EgTCP基因的长度均相对较短,其中14个基因只有1个外显子,EgTCP11基因含外显子个数最多(5个);序列分析表明油棕TCP基因均含有高度保守的bHLH结构域,启动子上存在较多的植物激素响应及逆境应答等顺式作用元件;系统进化分析显示28个油棕TCP蛋白被划分为Class Ⅰ(13个蛋白)和Class Ⅱ(15个蛋白)两大类,其中Class Ⅱ进一步分为CYC/TB1(4个蛋白)和CIN(11个蛋白)两个亚类;通过表达模式分析发现花中特异表达的TCP基因数量最多(EgTCP05,EgTCP09,EgTCP15,EgTCP27和EgTCP28),EgTCP27基因在中果皮中的表达量逐渐上调,到花后23周时表达量升至最大.本研究为进一步探索油棕TCP基因的生物调控功能提供一定的理论基础.
Bioinformatics Identification and Gene Expression Analysis of TCP Tran-scription Factor Family in Oil Palm

周丽霞、赵志浩、杨蒙迪、曹红星、杨耀东

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中国热带农业科学院椰子研究所,海南省热带油料作物生物学重点实验室,文昌,571339

油棕 TCP转录因子 全基因组鉴定 表达分析

321MS098318706701630152017008

2022

10.13271/j.mpb.020.005637

分子植物育种
海南省生物工程协会

分子植物育种

CSTPCD北大核心
影响因子：0.765
ISSN：1672-416X
年,卷(期)：2022.20(17)
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