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光皮树基因组SSR特征分析

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光皮树是重要的木本油料树种,为了探究光皮树的遗传背景,本研究利用高通量测序技术对光皮树基因组进行了测序,并利用MISA软件开展SSR位点信息搜索和分析,共检索到重复单元长度为2～6个核苷酸的SSR位点200 558个,SSR的发生频率为15.27％,平均分布距离为1/4.47 kb.二核苷酸重复类型SSR数量最多,所占比例为67.74％,SSR中优势重复基元富含A/T核苷酸.4次重复的SSR数量最多,占总数的21.40％,重复次数在4～10次的SSR数量占总数的82.49％.SSR基序长度在12～90 bp之间,其中12 bp的SSR数量最多,占总数的32.46％,基序长度在12～20 bp的SSR数量占总数的70.58％.研究结果表明,光皮树基因组SSR数量及类型较丰富,为光皮树SSR分子标记的开发、种质资源遗传评价、分子标记辅助育种等提供基础.
Analysis of SSR Characteristics in Genome of Swida wilsoniana

周文才、唐山、何小三、李进、贺义昌、左继林、龚春

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江西省林业科学院,江西省油茶种质资源保护与利用重点实验室,南昌,330013

光皮树(Swida wilsoniana) SSR 基因组 重复类型

江西省重点研发项目江西省林业科技创新项目

20202BBFL63018创新专项[2019]22号

2023

10.13271/j.mpb.021.001618

分子植物育种
海南省生物工程协会

分子植物育种

CSTPCD北大核心
影响因子：0.765
ISSN：1672-416X
年,卷(期)：2023.21(5)
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