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'玉铃铛'枣叶绿体基因组特征及密码子偏性

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为探究'玉铃铛'枣叶绿体基因组密码子的使用模式,本研究利用Illumina NovaSeq平台进行测序并组装,获得其叶绿体全基因组序列;利用CodonW 1.4.2、CUSP、SPSS、MISA v1.0等软件分析其密码子偏好性.结果表明,'玉铃铛'枣叶绿体基因组大小为161 720bp,注释共得到131个基因,包括86个蛋白编码基因,37个tRNA基因和8个rRNA基因;密码子的第三位的GC含量为28.82％,有效密码子数范围为33.72～59.39,RSCU＞1的密码子30个,高表达优越密码子27个,对比得到最优密码子9个,且均已A/U结尾;密码子偏性分析均表明,'玉铃铛'枣叶绿体基因组使用密码子的偏性受选择影响更大.本研究对叶绿体基因组密码子优化和鼠李科系统进化的相关研究提供重要参考.
Chloroplast Genome Characteristics and Codon Usage Bias of'Yulingdang'Jujuba

郭晓雨、张晓慧、马宗新、李文峰、李慧慧

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阜阳市农业科学院,阜阳,236065

'玉铃铛'枣 叶绿体基因组 密码子偏好性 最优密码子

安徽省林业科技创新研究计划

AHLYCX-2021-21

2023

10.13271/j.mpb.021.002488

分子植物育种
海南省生物工程协会

分子植物育种

CSTPCD北大核心
影响因子：0.765
ISSN：1672-416X
年,卷(期)：2023.21(8)
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