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檀香科半寄生植物叶绿体基因组比较与进化分析

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檀香科植物具有极高的观赏价值与经济价值,其中大多数为半寄生物种,包括兼性半寄生与专性半寄生类型,在半寄生类植物系统发育研究中具有重要的地位.本研究以檀香科12个半寄生物种叶绿体基因组序列为研究对象,分析其基因组基本特征、基因组比较以及系统进化关系.结果表明:(1)基因组特征分析方面:与典型的被子植物叶绿体基因组相比,檀香科半寄生物种叶绿体基因组略有缩短.檀香科物种密码子偏好性与其他陆生植物一致,密码子第三位更偏好A或T.重复序列和SSR序列鉴定结果表明,槲寄生属物种与其他物种在序列数目和长度上存在差异.(2)基因组比较分析发现,部分檀香科植物IR区域扩张引起了LSC-IR边界改变,IR-SSC区域差异是边界处基因区域倒置的结果.此外,部分蛋白编码基因(ndh,infA,matK,rpl33和ccsA)被假基因化或完全缺失.(3)基于叶绿体全基因组序列构建的系统发育树揭示了檀香科物种之间的进化关系,结果显示檀香科半寄生物种叶绿体基因组可能以谱系特异性方式进化.本研究结果为檀香科种间鉴别、SSR分子标记开发、系统发育和叶绿体基因组进化提供了理论基础.
Comparison and Evolutionary Analysis of Chloroplast Genomes in Hemi-parasitic Plants of the Santalaceae

王马寅、张晓明、丁宇、唐敏强、谢尚潜

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海南大学林学院,热带特色林木花卉遗传与种质创新教育部重点实验室,海口,570228

内蒙古农业大学草原与资源环境学院,呼和浩特,010011

檀香科 叶绿体基因组 寄生 系统发育

海南省自然科学基金海南省自然科学基金内蒙古自治区自然科学基金国家自然科学基金国家自然科学基金

320RC500321RC4692019MS030523206014931760316

2023

10.13271/j.mpb.021.002908

分子植物育种
海南省生物工程协会

分子植物育种

CSTPCD北大核心
影响因子：0.765
ISSN：1672-416X
年,卷(期)：2023.21(9)
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