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海带全基因组SSR分子标记开发

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海带(Saccharina japonica)是大型食用海藻,具有重要的经济价值.SSR(简单序列重复)标记因其多态性好、简单易用等优点,被广泛应用于遗传学研究和育种工作中.目前,海带基因组已被成功解析,但其全基因组SSR标记集尚未被开发.本研究通过对海带全基因组序列进行SSR位点识别、引物开发以及引物扩增特异性的电子PCR验证,在全基因组水平上分析了 SSR标记的特征.本研究鉴定得到77 551个SSR标记,其中有51 338个SSR标记分布于31条染色体的区段,平均每7.07 kb有1个SSR标记,实现了对海带全基因组的高度覆盖.本研究所鉴定的SSR标记集为海带种质资源鉴定、遗传连锁图谱构建、遗传多样性分析、群体遗传结构分析、基因资源挖掘以及分子标记辅助育种等应用奠定了基础.
Genome-wide Development of SSR Markers in Saccharina japonica

林锦彬、伍永久、韩艺娟、陈松彪、唐唯其

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闽江学院地理与海洋学院,海洋生物与药物福建省高校工程研究中心,福州,350108

福建农林大学农学院,福州,350002

福建农林大学生命科学学院,福州,350002

闽江学院,福州海洋研究院,海洋生物技术研发中心,福州,350108

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海带 全基因组 SSR 标记开发

福建省自然科学基金福建省教育厅中青年教师教育科研项目(科技类)福建省科技重大专项福州海洋研究院科技项目

2020J01851JAT1906262022NZ0330212022F08

2023

10.13271/j.mpb.021.003964

分子植物育种
海南省生物工程协会

分子植物育种

CSTPCD北大核心
影响因子：0.765
ISSN：1672-416X
年,卷(期)：2023.21(12)
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