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人参PgPP2C2基因的克隆及生物信息学分析

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2C型蛋白磷酸酶(PP2C)是最大的蛋白磷酸酶家族，PP2C蛋白在响应不同非生物胁迫中发挥着重要作用。为了探究人参PgPP2C2基因的功能，基于实验室前期转录组数据库，从人参中克隆了一个2C型蛋白磷酸酶基因，命名为PgPP2C2，并对PgPP2C2基因的序列、编码蛋白质的结构进行分析，预测了其功能。研究结果表明，该核苷酸序列的开放阅读框为1 269 bp，编码422个氨基酸。其编码蛋白质属于亲水性蛋白，无信号肽，未形成跨膜结构域，包含2C家族丝氨酸/苏氨酸磷酸酶催化结构域。通过蛋白互作分析，发现PgPP2C2蛋白与HOG1(参与渗透调节的丝裂原活化蛋白激酶)和NBP2(NAP1-binding蛋白2，参与HOG途径的蛋白)的互作分数分别高达0。996和0。984，推测PgPP2C2蛋白可能参与渗透胁迫调节及磷酸化过程。本研究结果可为后期进一步研究PgPP2C2基因的功能和开展人参种植调控提供理论基础。
Cloning and Bioinformatics Analysis of Protein Phosphatase 2C2(PgPP2C2)Gene from Panax ginseng

Panax ginsengPP2C2 geneBioinformatics analysis

梁浩、张亚玉、孙海、李美佳、张正海、邵财、王莹

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中国农业科学院特产研究所,吉林省中药材种植(养殖)重点实验室,长春,130112

成都大学药学与生物工程学院,成都,610106

吉林省白山本苜药业有限公司,长春,130112

人参(Panax ginseng) PP2C2基因 生物信息学分析

现代农业产业技术体系建设项目中国农科院科技创新工程协同创新任务项目吉林省非林地老参地再利用土壤修复技术研究与栽培示范项目中国农科院基本科研业务费专项中国农业科学院协同创新项目

CARS-21CAAS-XTCX20190025-6RSTCYFZZX-JA2018-10Y2019XK2-03CAAS-XTCX2018021

2023

10.13271/j.mpb.021.005221

分子植物育种
海南省生物工程协会

分子植物育种

CSTPCD北大核心
影响因子：0.765
ISSN：1672-416X
年,卷(期)：2023.21(16)
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