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辣椒杂交种与亲本苗期叶片基因差异表达分析

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目前辣椒杂种优势的利用已取得很大成效,但是辣椒杂种优势的分子机理仍然不明.辣椒杂种优势的分子机理是一个重要的生物学和农学课题.为比较分析苗期辣椒杂交种(D6×D7,D7×D6)及其亲本(D6、D7)的成熟功能叶转录谱,把4个功能叶eDNA文库在Illumina HiSeq 2000平台进行RNA-Seq分析.通过转录组测序,共得到0.6亿条原始的reads,经过筛选获得0.44亿条高质量reads(100 bp).基因存在与缺失变异统计结果表明,单亲表达一致型有1068个(6.20％)和780个(4.56％)基因分别在正交(D6×D7)和反交(D7 × D6)中被检测到,在4种基因存在与缺失变异类型中所占比例比较高.对双亲 表达量不同的基因作进一步表达模式分析,结果表明,杂种(正、反交)与双亲相比,大部分基因呈均非加性表达,加性表达基因比例不足8％,在非加性表达基因中,超显性表达的基因占大多数,正、反交分别为66.08％和62.96％,这与偏单亲的显性模型分析结论相一致.
Differentially expressed gene profile of hot pepper seedling leaves between hybrid and its parental lines

徐小万、李颖、王恒明、李涛、何水林、官德义

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广东省农科院蔬菜研究所,广东广州510640

福建农林大学作物科学学院,福建福州350002

辣椒 杂种优势 转录组 RNA-seq

国家自然科学基金广东省科技计划项目广东省科技计划项目广州市科技计划项目

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2016

10.16768/j.issn.1004-874X.2016.11.006

广东农业科学
广东省农业科学院 华南农业大学

广东农业科学

CSTPCD
影响因子：0.556
ISSN：1004-874X
年,卷(期)：2016.43(11)
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