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紫芝栽培新品种武芝2号基于rDNA-ITS和ITS2的分子鉴定与分析

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[目的]探讨利用rDNA-ITS及其ITS2二级结构进行紫芝栽培新品种武芝2号(原名紫芝S2)的分子鉴定.[方法]通过第一代和第三代测序技术分别获得武芝2号的ITS序列,针对灵芝属(Ganoderma spp.)相关种类的ITS序列构建系统进化树进行分子分类鉴定,采用rDNA-ITS及相关引物序列进行BLAST比对分析,在线预测ITS2二级结构.[结果]Sanger法测序得到的武芝2号ITS序列(MG282563.1,649 bp),与GenBank中5个紫芝ITS序列具有高相似度(99.53％～100％),并且与已知4个紫芝菌株或实物标本在灵芝属系统进化树上聚为一个分支,同属一个种群.已知2个紫芝特异性引物短序列(GS1_22bp、GS2_22bp)出现在武芝2号ITS序列的119～140 bp正向和588～567 bp反向位置;在武芝2号基因组Scaffold No.49上rDNA中找到4个串联重复的ITS区域,与Sanger法测序得到的单个ITS序列高度一致;在ITS2序列二级结构上,武芝2号与ITS2数据库中紫芝Ganoderma sinense的3个螺旋区结构相同,仅螺旋IV区间夹角不同.[结论]基于ITS和ITS2分子鉴定,确认了武芝2号与已知紫芝G.sinense同属一个种群,在ITS2二级结构螺旋IV区存在夹角差异;此外,验证了2个已知紫芝特异性扩增引物的有效性.
Molecular Identification and Analysis of New Cultivar Wuzhi No. 2 Based on Ribosomal DNA ITS and ITS2 Sequence

钟礼义、应正河、刘新锐、陈体强

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福建省农业科学院食用菌研究所,福建 福州 3500413

武平县食用菌技术推广服务站,福建 武平 364300

福建农林大学菌物研究中心,福建 福州 350002

紫芝 武芝2号 紫芝S2 rDNA ITS/ITS2 序列分析

福建省财政专项-福建省农业科学院创新团队建设项目福建省财政专项-福建省农业科学院创新团队建设项目

CXTD2021-2-14STIT2017-2-8

2022

10.16768/j.issn.1004-874X.2022.02.002

广东农业科学
广东省农业科学院 华南农业大学

广东农业科学

CSTPCD
影响因子：0.556
ISSN：1004-874X
年,卷(期)：2022.49(2)
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