以kaiC基因簇部分已知序列为引物设计位点，采用PCR反应池法从节旋藻基因组fosmid文库中筛选到kaiC基因克隆，通过步移测序获得了kaiC基因全长序列。kaiC基因编码区长1554 bp，基因GC碱基含量平均为41。76%，密码子第三位明显偏向于U。在基因上游385 bp范围内发现一个可能的启动子序列和一些基因调控元件。KaiC蛋白分析发现了Walker A、DXXG、不完整的Walker B等重要模体和具有催化作用的功能位点。Southern杂交的结果证明kaiC基因在极大节旋藻中为单拷贝。极大节旋藻kaiC基因的特殊结构特征为研究kai基因簇的进化提供了重要的启示。
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