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苹果属15个种的叶绿体DNA变异与遗传分化

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[目的]利用叶绿体基因(cpDNA)标记,对近十年间在我国苹果属植物的主要密集分布区收集的15种苹果属植物的叶绿体DNA进行序列变异分析,开展其遗传分化和遗传结构研究.[方法]利用4对叶绿体DNA引物扩增722份种质的4个非编码区trnH-psbA、trnS-trnG spacer+intron、trnT-5'trnL和5'trnL-trnF,对每个基因间区正反向测序获得的序列进行人工校对后,使用MEGA7.0进行序列拼接和比对,使用DnaSPver5.10.01计算叶绿体DNA的遗传多样性参数,利用Arlequin v3.5分析标准分子变异(AMOVA),运用NetWork ver4.6.1.2构建种内居群间的叶绿体DNA单倍型邻接网络关联图.[结果]4个cpDNA区域经测序、拼接、比对和合并之后的片段长度为4 120 bp,共有579个多态性变异位点,单倍型为100个,核苷酸多样性(Pi)和单倍型多样性(Hd)分别为0.008 52和0.879.Tajima's D检验中,15种苹果属植物的4个cpDNA区域合并后遵循中性模型.AMOVA分析表明,遗传变异主要存在于种群内,但种群间遗传变异也占较大比重.[结论]中国原产苹果属植物在叶绿体DNA水平具有较高的遗传多样性,苹果属植物不同种具有不同的演化路线,各个种间以及种内起源演化关系错综复杂.山荆子和新疆野苹果的部分种质占据较为古老的单倍型,并在发展演化过程中经历过种群扩张.苹果属栽培种中国苹果、花红、楸子和八棱海棠的部分单倍型晚于部分新疆野苹果的单倍型.
Genetic divergence and population structure of chloroplast DNA in fif-teen species of Malus Mill

高源、王大江、王昆、丛佩华、李连文、朴继成

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中国农业科学院果树研究所•农业农村部园艺作物种质资源利用重点实验室,辽宁兴城125100

苹果属 种群 叶绿体基因 遗传分化 遗传结构

中国农业科学院科技创新工程农作物种质资源保护

CAAS-ASTIP-2018-RIP-02NB2015-2130135-39

2021

10.13925/j.cnki.gsxb.20200205

果树学报
中国农业科学院郑州果树研究所

果树学报

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子：1.486
ISSN：1009-9980
年,卷(期)：2021.38(1)
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