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10种蔷薇科果树AAT基因家族鉴定、特性与表达分析

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[目的]利用生物信息学对10种蔷薇科果树的AAT基因家族进行分析,为果实香气调控的候选基因鉴定提供前期基础.[方法]基于10种蔷薇科果树的全基因组测序结果,应用保守结构域鉴定不同果树的AAT基因家族,分析其理化性质、保守域结构、亚组分类、进化关系、内含子与外显子结构、染色体定位等信息.[结果]10种蔷薇科果树中共鉴定出46个AAT基因序列,分别为中国白梨4个、梅4个、桃8个、苹果7个、西洋梨4个、杜梨6个、甜樱桃2个、森林草莓1个、凤梨草莓7个以及黑树莓3个,各物种AAT基因随机分布在染色体上.通过聚类分析,将这46条基因序列分为4个区组;亚细胞定位与理化性质分析显示,AAT蛋白主要定位于细胞质上,整体在弱酸性至弱碱性的范围内,为亲水性蛋白,同时大部分蛋白呈现不稳定的状态.通过共线性与表达分析,发现蔷薇科果树AAT基因家族在其进化过程中主要受纯化选择作用的影响.[结论]在10种蔷薇科果树中,共鉴定出46个AAT基因家族序列,最少的为森林草莓(1个),最多的为桃(8个).AAT基因家族的各序列结构相对保守,受纯化作用的影响明显.
Identification,characterization and expression analysis of alcohol acetyl-transferase (AAT) gene family in 10 Rosaceae fruit trees

温思为、张黄伟、岳超、李梦

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南京农业大学园艺学院,南京210095

江苏中烟工业有限责任公司,南京210019

蔷薇科 醇酰基转移酶 AAT 基因家族 香气物质

KYYJ202117

2021

10.13925/j.cnki.gsxb.20200523

果树学报
中国农业科学院郑州果树研究所

果树学报

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子：1.486
ISSN：1009-9980
年,卷(期)：2021.38(7)
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