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核桃NAC基因家族的全基因组鉴定与分析

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[目的]探究核桃中的NAC转录因子及其在花器官形成过程中的表达特性.[方法]利用转录组和基因组数据库,结合生物信息学方法,对核桃N4C基因家族进行鉴定,并就其理化性质、亚细胞定位、系统发育、基因结构、保守基序、染色体定位、基因复制及蛋白调控网络进行分析.[结果]核桃中共鉴定到121个NAC家族成员,它们在16条染色体上不均等分布,根据系统发育树,核桃所有NAC成员被分为15个亚族;基因结构显示,大部分JrNAC成员含有3个外显子;共线性分析表明,核桃中有4个NAC基因在其他3个物种中均具有同源基因,且其中的2个基因(JrNAC44和JrNAC108)在核桃基因组中出现基因复制现象.基因表达分析显示,7个JrNAC基因在雌雄花芽的3个时期均高表达,特别是JrNAC8和JrNAC115.[结论]核桃NAC基因较为保守,但仍发挥多样性的功能.JrNAC2、JrNAC8、Jr-NAC115和JrNAC97基因可能为核桃花器官发育过程中的关键基因.
Genome-wide identification and analysis of NAC gene family in walnut(Juglans regia L.)

亢超、郭彩华、张雪蒙、刘金明、袁星、全绍文、牛建新

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石河子大学农学院园艺系·特色果蔬栽培生理与种质资源利用兵团重点实验室,新疆石河子832003

核桃 NAC基因家族 生物信息学 表达模式

国家自然科学基金

32060668

2021

果树学报
中国农业科学院郑州果树研究所

果树学报

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子:1.486
ISSN:1009-9980
年,卷(期):2021.38(9)
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