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沃柑果皮响应柑橘锈螨危害的转录组分析

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[目的]揭示柑橘抗柑橘锈螨危害的分子机制,筛选出在柑橘锈螨危害条件下的相关应答基因.[方法]研究以接种柑橘锈螨后危害3、5、7、9d的沃柑果实为试材,健康果实为对照(CK),采用Novaseq6000平台进行转录组双向测序,并对数据进行生物信息学相关性分析.[结果]共获得了 55.63 Gb clean bases,去除低质量碱基和接头序列后,CK3、CK5、CK7和CK9获得Cleanreads分别是42 115 939、45 501 683、58 118 008和40 715 511 条,WG3d、WG5d、WG7d和WG9d获得Clean reads分别是46 807 089、49 185 798、44 437 798和44 035 730条.柑橘锈螨危害3、5、7、9 d后引起上调差异表达基因数量分别为2764、1812、3217、2778个,下调差异表达基因数量分别为3036、1387、3350、2347个.GO功能富集分析结果显示,差异表达基因在不同的柑橘锈螨危害时间段,主要集中在生物学过程、细胞组分和分子功能中.KEGG注释分析结果显示,差异表达基因主要参与二苯乙烯、二芳基庚烷和姜辣素的生物合成、核糖体、磷酸戊糖、光合作用、碳代谢等途径.[结论]植物激素信号转导、植物病原互作通路、类黄酮生物合成、苯丙氨酸代谢、戊糖磷酸代谢5条通路在沃柑响应柑橘锈螨胁迫过程中起到了重要的调控作用.
Transcriptome analysis of citrus rustmite damage to the peel of Orah fruits

田帅、邱发发、葛聪聪、黄桂香、王国全

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广西农业环境与农产品安全重点实验室·植物科学国家级实验教学示范中心·广西大学农学院,南宁530004

沃柑 柑橘锈螨 转录组 差异表达基因

国家重点研发计划支持项目广西科技重大专项广西现代农业产业技术体系柑橘创新团队

2018YFD0201500桂科AA17204026nycytxgxcxtd-05-08

2021

10.13925/j.cnki.gsxb.20200590

果树学报
中国农业科学院郑州果树研究所

果树学报

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子：1.486
ISSN：1009-9980
年,卷(期)：2021.38(9)
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