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梨自交不亲和基因克隆及其进化分析

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[目的]获得梨S-RNase基因全长序列及其进化、遗传多态性情况.[方法]设计特异性引物扩增梨S42-RNase基因组DNA全长序列,利用RT-PCR结合cDNA末端快速扩增(rapid amplification of cDNA ends,RACE)技术获得其cDNA全长序列.构建梨属植物S-RNase基因编码区和高变区(hyper variable region,HV)内含子的系统发育树.[结果]梨S42-RNase基因编码226个氨基酸,包含由27个氨基酸组成的信号肽,由11、11、6、8、7个氨基酸组成的5个保守区以及HV区插入的335 bp内含子序列.系统进化树显示,梨S-RNase基因编码区和HV区内含子的拓扑结构既相似又有差异.编码区Normalized dN-dS结果显示,除了HV区外还有几个区域存在大量的非同义替换,表明对阳性选择具有很高的敏感性.[结论]梨S-RNase基因编码区和HV区内含子的进化存在一定的关联性,除HV区外还存在其他区域参与梨雌蕊与花粉间特异识别.梨S-RNase基因编码区进化动力源自其编码特异识别蛋白的功能,是平衡选择的结果.HV区的内含子序列表现出很高的长度多态性,进化受到负选择的压力.
Cloning and phylogenetic analysis of S-RNase genes in genus Pyrus plants

梁文杰、谭晓风、乌云塔娜

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温州科技职业学院,浙江温州325006

中南林业科技大学经济林育种与栽培国家林业和草原局重点实验室,长沙410004

中国林业科学研究院经济林研究开发中心,郑州450003

S-RNase 基因克隆 进化分析

国家自然科学基金

31000309

2021

果树学报
中国农业科学院郑州果树研究所

果树学报

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子:1.486
ISSN:1009-9980
年,卷(期):2021.38(10)
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