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干旱胁迫下葡萄AQP基因家族的鉴定及转录调控网络预测

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[目的]探究干旱胁迫下葡萄AQP的转录调控网络,为后续研究葡萄抗旱基因功能和转录调控机制提供理论依据.[方法]通过生物信息学方法分析葡萄AQP基因家族成员的理化性质、系统进化和染色体定位,进行共线性分析和转录因子调控预测,通过转录组数据分析该基因家族在干旱胁迫和脱落酸(abscisic acid,ABA)处理下的表达情况.[结果]37个VvAQP基因主要分为PIP、TIP、NIP、SIP四类,分别分布在17条染色体上,复制分析结果表明,共有5对节段复制和2对串联复制.蛋白序列分析表明,每个VvAQP蛋白序列中均有1个植物AQP主要内在蛋白(major in-trinsic proteins,MIP)的保守结构域特征.通过转录调控网络预测发现,靶向VvAQP基因的转录调控因子主要分为16类.干旱胁迫下,根和叶中大部分VvAQP基因表达持续下调,VvPIP2-3、VvPIP2-6在根中持续上调,7个VvAQP基因受ABA显著诱导.干旱胁迫下15个差异表达的转录因子可能与13个VvAQP基因存在调控关系.[结论]鉴定并提供了葡萄AQP基因家族成员的基本信息,通过转录组数据发现可能参与干旱胁迫的VvAQP基因,并预测了这些基因的转录调控网络.
Identification of grapevine AQP family and prediction for transcriptional regulatory network under drought stress

杨盛迪、郭大龙、裴茂松、刘海楠、韦同路、余义和

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河南科技大学园艺与植物保护学院,河南洛阳471023

河南省园艺植物品质调控工程技术研究中心,河南洛阳471023

葡萄 AQP 干旱胁迫 转录因子 调控

国家自然科学基金河南省高校科技创新人才计划河南省高校科技创新团队支持计划河南省高等学校青年骨干教师培养计划洛阳市科技发展计划项目

3170189321HASTIT03521IRT-STHN021812101102A

2021

10.13925/j.cnki.gsxb.20210202

果树学报
中国农业科学院郑州果树研究所

果树学报

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子：1.486
ISSN：1009-9980
年,卷(期)：2021.38(10)
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