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对萼猕猴桃CDPK基因家族鉴定及非生物胁迫应答分析

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[目的]鉴定对萼猕猴桃(Actinidia valvata)CDPK家族基因,并分析其在不同组织的表达模式以及对盐胁迫和淹水胁迫的响应.[方法]基于3代全长转录组测序数据,通过多种生物信息学手段,分析和鉴定对萼猕猴桃CDPK家族基因,利用实时荧光定量PCR(quantitative real-time PCR,qRT-PCR)技术分析这些基因在不同组织中的表达,及在不同非生物胁迫条件下的表达情况.[结果]在对萼猕猴桃基因型KR5的全长转录组测序数据中共鉴定出63个CDPK基因,命名为AvCDPK1～AvCDPK63.系统发育分析将AvCDPK基因蛋白分为4个亚家族,同一亚家族具有相似的结构和基序(motif).AvCDPK基因存在明显的组织表达特异性.AvCDPK49在盐胁迫和淹水胁迫条件下,均显著诱导表达,AvCDPK30和31在2种胁迫下均显著抑制表达.[结论]在对萼猕猴桃中共鉴定出63个CDPK基因,系统发育树显示AvCDPK基因家族与拟南芥CDPK基因家族在进化上高度保守.不同组织中AvCDPK的表达量存在明显差异,其中AvCDPK49受盐害、淹水诱导显著高表达,表明其可能在猕猴桃的耐盐和耐涝响应过程中发挥着重要作用.
Identification of CDPK family genes and their response to abiotic stresses in Actinidia valvata

张永杰、白丹凤、Muhammad Abid、李志、方金豹、钟云鹏

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中国农业科学院郑州果树研究所·果树生长发育与质量控制重点实验室,郑州450009

对萼猕猴桃 全长转录组 CDPK基因家族 盐胁迫 淹水胁迫

国家自然科学基金青年科学基金中国农业科学院科技创新工程国家成都农业科技中心项目中央级科研院所基本科研业务费专项

31801846CAAS-ASTIP-2020-ZFRINASC2020AR07Y2019LM13

2021

10.13925/j.cnki.gsxb.20210168

果树学报
中国农业科学院郑州果树研究所

果树学报

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子：1.486
ISSN：1009-9980
年,卷(期)：2021.38(10)
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