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山核桃实时荧光定量PCR分析中内参基因的筛选与验证

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[目的]筛选出山核桃中的最佳内参基因.[方法]以山核桃的根、茎、叶、柱头、果皮、胚、不同处理下的叶片及嫁接后的砧木和接穗为试验材料,利用geNorm、NormFinder、BestKeeper和RefFinder4种软件对10个管家基因家族(ARF、ACT1、ACT7、MPS、UBC9、CYP、60SRP、EF-1α、GAPHD和HIS)中的19个候选内参基因表达的稳定性进行综合分析.[结果]通过比较不同组织内参基因表达的稳定性,排名前五的5个基因(ARF-1、60SRP、ACT7-1、ACT1-1和UBC9-5)被选出且ARF-1和60SRP的表达最稳定.geNorm分析显示:在盐、干旱及嫁接处理后,60SRP的表达最稳定;外源喷施不同激素到山核桃叶面后,UBC9-5的表达最为稳定;综合所有组织和处理发现UBC9-5为最稳定表达的基因.NormFinder和RefFinder综合分析的结果与geNorm分析结果基本一致,而与BestKeeper分析相差较大.[结论]在山核桃的不同组织及不同试验处理中,最适的内参基因有所不同,其也受分析方法的影响.
Screening and verification of internal reference genes by real time quanti-tative PCR analysis in Carya cathayensis

赵艺蕊、黄春颖、王克涛、徐一帆、王建华、邢语琳、陶瞫宸、黄坚钦、李岩

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浙江农林大学,浙江临安311300

山核桃 组织 内参基因 实时荧光定量PCR

省级财政林业科技推广项目浙江省重点研发专项浙江省农业新品种选育重大科技专项

2021B022021C020372021C02066-12

2022

果树学报
中国农业科学院郑州果树研究所

果树学报

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子:1.486
ISSN:1009-9980
年,卷(期):2022.39(1)
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