首页|山核桃油体蛋白oleosin基因家族鉴定和表达模式分析

山核桃油体蛋白oleosin基因家族鉴定和表达模式分析

扫码查看
[目的]探讨山核桃中oleosin基因家族表达模式,筛选响应油脂合成的关键oleosin基因.[方法]以山核桃(Carya cathayensis)和薄壳山核桃(Carya illinoinensis)为研究对象,利用生物信息学方法鉴定oleosin基因家族成员,分析其蛋白的理化性质、保守基序;解析基因结构、启动子区域顺式作用元件;预测oleosin基因的系统进化关系;探究oleosin基因在胚发育不同阶段的表达模式及亚细胞定位.[结果]山核桃和薄壳山核桃基因组中分别鉴定到7个和8个含"脯氨酸结"保守基序PX5SPX3P的oleosin基因家族成员,这些基因所编码的蛋白分子质量14.54~17.51 ku;启动子区域顺式作用元件分析显示,oleosin基因家族成员均含有响应光周期、逆境胁迫和激素应答等相关的顺式作用元件;系统进化分析显示15个oleosin基因家族成员主要分布在U-Oleosin、SL-Oleosin和SH-Oleosin 3个亚家族;转录组数据显示,山核桃7个oleosin基因在胚发育不同阶段均表现出不同程度上调表达,其中CCA0520S0025和CCA0791S0002在山核桃胚油脂迅速增长阶段基因表达量显著上调;荧光定量PCR结果显示,山核桃oleosin基因CCA0520S0025和CCA0791S0002响应ABA和低温胁迫,同时亚细胞定位分析表明山核桃CCA0520S0025和CCA0791S0002蛋白均定位于油体.[结论]山核桃和薄壳山核桃oleosin基因家族成员均具有相似的基因结构与保守基序,亲缘关系较近,另外山核桃CCA0520S0025和CCA0791S0002可能在油脂合成过程中发挥重要作用.
Identification and expression profile analysis of oleosin gene family in Chinses hickory and pecan

董茗秀、易芳、胡帅、高燕丽

展开 >

浙江农林大学·省部共建亚热带森林培育国家重点实验室,浙江临安 311300

山核桃 薄壳山核桃 Oleosin基因 生物信息学 亚细胞定位

浙江农林大学科研发展基金浙江农林大学科研发展基金

2021FR0122020KJ001

2023

果树学报
中国农业科学院郑州果树研究所

果树学报

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子:1.486
ISSN:1009-9980
年,卷(期):2023.40(1)
  • 7