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桃花花型(铃形/蔷薇形)基因型鉴定、分子标记开发与利用

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[目的]进一步完善桃花型基因型分类,开发桃花型相关分子标记,为观赏桃花的分子辅助育种提供理论支持.[方法]利用全基因组关联分析(genome-wide association study,GWAS)、IGV可视化软件分析,以及竞争性等位基因特异性PCR(Kompetitive allele-specific PCR,KASP)技术,在定位到的候选位点进行鉴定分析.[结果]GWAS定位分析在Pp08:14518604～14521291 bp存在一个ms179810转座子的缺失,x2验证结果表明,转座子的插入与缺失与花型性状无显著性关系.在转座子上游33980 bp处鉴定到一个单碱基核苷酸(SNP)变异,变异类型分为CC型、AC型、AA型3种,比对结果显示基因型为CC型、AC型,其表型为铃形,基因型为AA型,其表型为蔷薇形,在145份桃自然群体中鉴定准确率为98.62％.但是通过表型比对发现,基因型为CC时,铃形花冠直径为(1.54±0.46)cm,同时,基因型杂合的中蟠17号自交群体后代192株中基因型与表型准确率在98.44％.[结论]根据桃基因组中Pp08:14484624 bp处的变异类型以及桃花型的调查结果,首次将铃形花基因型细分为纯合铃形和杂合铃形,且开发了同时鉴定纯合铃形、杂合铃形及蔷薇形的分子标记.
Identification of peach flower genotype(Non-showy/Showy),develop-ment of flower-type related molecular markers

吉爽秋、王力荣、李勇、朱更瑞、曹珂、方伟超、陈昌文、王新卫、张琦、吴金龙

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塔里木大学园艺与林学院,新疆阿拉尔 843300

中国农业科学院郑州果树研究所,郑州 450009

桃 花型 全基因组关联分析(GWAS) IGV 竞争性等位基因特异性PCR(KASP)

新疆维吾尔自治区研究生科研创新项目中国农业科学院科技创新工程项目

XJ2022G246CAAS-ASTIP-ZZFR-01

2023

10.13925/j.cnki.gsxb.20220376

果树学报
中国农业科学院郑州果树研究所

果树学报

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子：1.486
ISSN：1009-9980
年,卷(期)：2023.40(3)
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