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中华猕猴桃全基因组MADS-box基因家族鉴定及表达分析

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[目的]鉴定并分析中华猕猴桃MADS-box基因家族成员,探明MADS-box基因家族成员在果实生长发育及芽休眠中的表达模式.[方法]基于中华猕猴桃红阳V3基因组数据库,利用生物信息学方法对中华猕猴桃MADS-box全基因组进行鉴定,分析其家族成员的理化性质、系统进化树、保守基序、顺式作用元件,并对其在果实生长发育及不同组织中的表达模式进行分析.[结果]在中华猕猴桃红阳基因组中鉴定到了68个AcMADS-box基因,共包含11个亚家族,不均匀地分布于22条染色体上,成员间共存在32对共线性基因对;在基因家族上游启动子区域发现与光响应、激素响应、逆境胁迫响应等相关的顺式元件;17个AcMADS-box基因在组织间高表达且有表达特异性,推测是参与调控中华猕猴桃生长发育的关键基因.[结论]初步鉴定并提供了AcMADS-box家族成员信息,16个AcMADS-box家族成员在根、枝、茎、叶、花中高表达,8个家族成员在花芽中高表达.结果为进一步研究AcMADS-box参与中华猕猴桃的生长发育调控机制提供参考.
Genome-wide identification and expression analysis of the MADS-box gene family in Actinidia chinensis

Actinidia chinensisMADS-boxOptical responseCis-acting elementGrowth and devel-opment

高欢、郑珂昕、廖光联、王海令、陈璐、贾东峰、黄春辉、曲雪艳、徐小彪

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江西农业大学农学院,南昌 330045

江西农业大学猕猴桃研究所,南昌 330045

中华猕猴桃 MADS-box 光响应 顺式元件 生长发育

国家自然科学基金

32160692

2023

10.13925/j.cnki.gsxb.20230104

果树学报
中国农业科学院郑州果树研究所

果树学报

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子：1.486
ISSN：1009-9980
年,卷(期)：2023.40(11)
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