摘要
IQ67-DOMAIN(IQD)蛋白家族是一类钙调素靶点互作蛋白,其特征是有67个保守氨基酸残基组成的特异性中心结构域,简称IQ67结构域,在各种生物和非生物胁迫中发挥重要作用,通过鉴定分析该家族的结构特征来预测其功能.利用生物信息学方法从甘蓝基因组中鉴定结球甘蓝IQD基因,分析其保守结构域、基因结构、分子进化和转录组数据等信息.共鉴定出28个IQD基因,命名为BoIQDl～BoIQD28,其不均匀地分布在9条染色体上.预测23个IQD蛋白亚细胞定位于细胞核中.系统发育树分析将结球甘蓝IQD蛋白分为4个类群(Ⅰ～Ⅳ),每个类群又可分为2个亚组.共线性分析表明,甘蓝和拟南芥之间有较高的同源性,大部分BoIQD基因在进化中受到纯化选择.转录组数据表明,BoIQD基因具有组织表达特异性,大部分在叶片中的表达量最高;所有的BoIQD蛋白都有一个共同的IQ域基序;21个BoIQD基因与拟南芥呈共线性关系.
基金项目
国家自然科学基金(31401908)
黑龙江省自然科学基金(C2016056)
黑龙江省省属高等学校基本科研业务费科研项目(145209513)
黑龙江省普通高等学校青年创新人才培养计划(UNPYSCT-2017155)
齐齐哈尔大学大学生创新创业项目(202220232209)
齐齐哈尔大学大学生创新创业项目(202220232135)
齐齐哈尔大学大学生创新创业项目(202010232197)
维普
万方数据