目的 采用计算机分子对接技术,研究芴酮衍生物与端粒G-四链体DNA的相互作用,为建立合理的化合物虚拟筛选模型提供依据.方法 使用SYBYL-X 2.0的分子对接模块,以2种结合了平面刚性骨架小分子的G-四链体DNA晶体结构为目标受体,在对接模型可靠性验证的基础上,选取经结构优化改造后的芴酮衍生物小分子为配体,以总评分为评价标准进行分子对接,研究小分子配体与G-四链体DNA的相互作用方式.结果 通过对比实验活性数据,分子对接模型的总评分能较好地反映化合物的细胞毒性强弱,并给出了多种分子间的相互作用模式.结论 通过分子模拟研究建立了比较可靠的对接模型,可在后续工作中指导化合物结构设计,寻找高活性抗肿瘤化合物.
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