摘要
目的 以天麻活性成分为切入点,基于分子对接筛选天麻治疗冠心病的物质基础.方法 借助化学专业数据库获取天麻活性成分,基于Swiss ADME预测理化性质,基于比较毒物基因组学数据库(Comparative Toxicogenomics Database,CTD)筛选冠心病靶点,借助STRING软件对冠心病的靶标进行相互作用分析,通过分子对接(SYBYL2.1.1,Tripos)将天麻活性成分与脂肪酸转运蛋白(CD36)、血管紧张素转换酶(ACE)、基质金属蛋白酶-3(MMP3)、尿激酶(PLAU)、载脂蛋白E(APOE)、载脂蛋白A(LPA)和低密度脂蛋白受体(LDLR)进行能量匹配,通过Cytoscape 3.5.1构建天麻-靶标蛋白网络模型;基于Ligplot计算小分子与靶标蛋白形成的氢键、疏水作用和结构比对.结果 天麻活性成分11个,基本遵循Lipinski规则.通过能量匹配发现PLAU、ACE、MMP-3和APOE为天麻防治冠心病的关键靶标蛋白.4,4'-二羟基二苯甲烷、天麻素、天麻醚苷、对-羟苄基乙醚、香草醇和4-(4'-羟苄氧基)苄基甲醚与尿激酶相互作用有很大的相似性,结构比对显示Gly115、Phe327和Phe328等氨基酸残基相对位置相同,氨基酸类型相同.结论 从分子层面筛选出天麻治疗冠心病的活性成分及关键靶点,为临床有效应用天麻提供理论依据.
基金项目
贵州省教育厅青年科技人才成长项目(黔教合KY字[2018]211)
贵州省科技计划项目(黔科合基础[2019]1028号)
贵州省普通高校特色重点实验室建设项目(黔教合KY字[2017]006)
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