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甘肃西峰黄土中细菌16S rDNA文库的构建与组成初步分析

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对黄土高原西峰地区黄土沉积物中的有机质进行了总DNA提取和PCR(聚合酶链式反应)扩增,通过克隆测序技术构建了含有44个克隆子的细菌16S rDNA文库.对16S rDNA系统发育的分析表明,西峰地区的黄土沉积物中细菌可分属13个类群,包括:酸杆菌(Acidobacteria)、变形菌(Proteobacteria)、放线菌(Actinobacteria)、绿弯菌(Chloroflexi)、厚壁菌(Firmicutes)、疣微菌(Verrucomicrobia)、浮霉菌(Planctomycetes)、芽单胞菌(Gemmatimonadetes)、异常球菌—栖热菌(Deinococcus-Thermus)、硝化螺旋菌(Nitrospirae)、蓝细菌(Cyanobacteria)、拟杆菌(Bacteroidetes)和Candidate division TG1.其中酸杆菌为最主要优势类群,变形菌为次优势类群,二者占黄土细菌总克隆数的70%,且大多为不可培养的基因型.
Construction and Preliminary Analysis of the 16S rDNA Clone Library of Bacteria in the Xifeng Loess Section, the Northwest of China

Loess16S rDNA clone libraryBacterial diversityAcidobacteria

黄晟、陈旸、潘雪莲、崔益斌、季峻峰、陈骏

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表生地球化学教育部重点实验室,南京大学 地球科学与工程学院,南京 210093

污染控制与资源化研究国家重点实验室,南京大学 环境学院,南京 210093

黄土 16S rDNA文库 细菌多样性 酸杆菌

国家自然科学基金国家自然科学基金国家自然科学基金

403310014060301941021002

2012

高校地质学报
南京大学

高校地质学报

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子:1.243
ISSN:1006-7493
年,卷(期):2012.(4)
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