南方农业学报2020,Vol.51Issue(10) :2367-2373.DOI:10.3969/j.issn.2095-1191.2020.10.007

袋料种植淮山药根际土壤细菌多样性的高通量测序分析

High-throughput sequencing analysis of rhizosphere soil bacterial diversity of yam planting in bag material

劳承英 韦本辉 周灵芝 申章佑 李艳英 胡泊 黄渝岚 周佳
南方农业学报2020,Vol.51Issue(10) :2367-2373.DOI:10.3969/j.issn.2095-1191.2020.10.007

袋料种植淮山药根际土壤细菌多样性的高通量测序分析

High-throughput sequencing analysis of rhizosphere soil bacterial diversity of yam planting in bag material

劳承英 1韦本辉 1周灵芝 1申章佑 1李艳英 1胡泊 1黄渝岚 1周佳1
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作者信息

  • 1. 广西农业科学院经济作物研究所,南宁 530007
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摘要

[目的]比较淮山药袋料种植方法与常规定向结薯种植方法的根际土壤微生物种群多样性,为利用微生物多样性指导淮山药袋料种植提供科学依据.[方法]采集常规淮山药定向结薯种植的根际土壤样品(记为CK3)和袋料种植的根际土壤样品(记为A3),对土壤样品中细菌的16S rDNA序列V4高变区进行PCR扩增,并对扩增产物进行高通量测序,分析土壤样品中细菌群落的多样性及其分布规律.[结果]CK3的pH为6.21,有机质含量为32.2 g/kg;A3的pH为5.98,有机质含量为30.0 g/kg.2种不同种植方法下淮山根际土壤样品中共检测出细菌41门100纲147目292科530属.淮山药根际土壤细菌在门水平上的主要优势类群有变形菌门(Proteobacteria)、酸杆菌门(Acidobacteria)、放线菌门(Actinobacteria)、绿弯菌门(Chloroflexi)和芽单胞菌门(Gemmatimonadetes);在纲水平上的主要优势类群有α-变形菌纲(Alphaproteobacteria)、γ-变形菌纲(Gammaproteobacteria)、β-变形菌纲(Betaproteobacteria)、放线菌纲(un-identified-Actinobacteria)和δ-变形菌纲(Deltaproteobacteria)等.在门和纲分类水平上,2种种植方法淮山药根际土壤样品中细菌的优势菌群相似,相对丰度差异不显著(P>0.05),CK3的细菌多样性高于A3.[结论]淮山药袋料种植方法可行,可在旱坡地和石山地等非耕地应用.

关键词

淮山药/袋料种植/根际土壤/细菌多样性/高通量测序

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基金项目

国家自然科学基金(31860347)

广西自然科学基金(2018GXNSFAA281012)

广西农业科学院科技发展基金(桂农科2017JM21)

出版年

2020
南方农业学报
广西壮族自治区农业科学院

南方农业学报

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子:0.83
ISSN:2095-1191
被引量3
参考文献量11
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