南方农业学报2020,Vol.51Issue(12) :3090-3098.DOI:10.3969/j.issn.2095-1191.2020.12.027

卵形鲳鲹MyoG基因克隆及其胚胎组织表达分析

Gene cloning of MyoG in Trachinotus ovatus and its embryonic tissues analysis

张永德 冯鹏霏 余艳玲 潘传燕 宋漫玲 肖蕊 罗洪林
南方农业学报2020,Vol.51Issue(12) :3090-3098.DOI:10.3969/j.issn.2095-1191.2020.12.027

卵形鲳鲹MyoG基因克隆及其胚胎组织表达分析

Gene cloning of MyoG in Trachinotus ovatus and its embryonic tissues analysis

张永德 1冯鹏霏 1余艳玲 1潘传燕 1宋漫玲 1肖蕊 1罗洪林1
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作者信息

  • 1. 广西水产科学研究院/广西水产遗传育种与健康养殖重点实验室,南宁 530021
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摘要

[目的]明确卵形鲳鲹胚胎发育中肌细胞生成素基因(MyoG)的表达规律,为阐明MyoG在卵形鲳鲹胚胎生长发育中的作用机制打下基础.[方法]采用RT-PCR扩增卵形鲳鲹MyoG基因全长序列,通过ProtParam、GOR IV、SWISS-MODEL、TMHMM、SignalP、PSORT及NetNGlyc 1.0等在线软件对其进行生物信息学分析;运用实时荧光定量PCR检测MyoG基因在卵形鲳鲹不同胚胎发育时期(受精卵、卵裂期、囊胚期、原肠胚期、胚胎形成期、眼囊期、耳囊期、心脏跳动期、晶体出现期和孵化期)的表达情况.[结果]从卵形鲳鲹胚胎组织中克隆获得的MyoG基因全长为1379 bp,编码233个氨基酸残基,其蛋白分子量为26059.19 Da,理论等电点(pI)为8.72;不稳定指数为75.23,即MyoG蛋白稳定性较差;总平均疏水指数(GRAVY)为-0.764,属于亲水性蛋白.卵形鲳鲹MyoG蛋白无跨膜结构,无信号肽序列,在第49位氨基酸处存在1个潜在的糖基化位点;卵形鲳鲹MyoG蛋白主要存在于细胞质和微体中,不属于分泌蛋白,其二级结构中以无规则卷曲占比最高(59.23%),其次为α-螺旋(21.46%)和延伸链(19.31%).MyoG基因相对表达量在卵形鲳鲹胚胎发育过程中呈明显的先升高后降低变化趋势.其中,在胚胎发育的前期(受精卵至胚体形成期)MyoG基因相对表达量极低,但从眼囊期开始其相对表达量迅速升高,至心脏跳动期达最高值;眼囊期、耳囊期和心脏跳动期3个时期的MyoG基因相对表达量均极显著高于胚胎发育前5个时期(P<0.01,下同);从晶体出现期开始,MyoG基因相对表达量极显著降低.[结论]MyoG基因除了在卵形鲳鲹眼囊期、耳囊期和心脏跳动期的分化形成过程中发挥重要作用外,在卵形鲳鲹胚胎器官分化形成后仍发挥着重要作用.

关键词

卵形鲳鲹/MyoG基因/胚胎发育/生物信息学/表达分析

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基金项目

广西创新驱动发展专项(桂科AA17204080-3)

广西创新驱动发展专项(桂科AA18242031-2)

广西水产遗传育种与康养殖重点实验室自主研发项目(17-A-01-02)

广西水产遗传育种与康养殖重点实验室自主研发项目(19-A-01-05)

出版年

2020
南方农业学报
广西壮族自治区农业科学院

南方农业学报

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子:0.83
ISSN:2095-1191
被引量1
参考文献量12
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