摘要
[目的]明确核因子NF-E2相关因子(Nrf2)基因生物学特性,并探究其在陆川猪和杜长大猪背最长肌中的表达差异,为深入研究陆川猪优质肌肉抗氧化性能的分子机制打下基础.[方法]以150日龄的陆川猪和杜长大猪背最长肌组织总RNA为模板,分段克隆Nrf2基因编码区(CDS)序列,并通过ExPASy ProtScale、ExPASy ProtParam及SWISS-MODEL等在线软件进行生物信息学分析,同时应用实时荧光定量PCR和Western blotting检测Nrf2基因在150日龄陆川猪和杜长大猪背最长肌中的表达差异.[结果]陆川猪和杜长大猪Nrf2基因CDS序列长1686 bp,与GenBank中已公布的野猪、杜长大猪、牛、绵羊、黑猩猩、猕猴、狼、人类、家鼠、大白鼠、鸵鸟和普通家鸡的Nrf2基因CDS序列的同源相似性分别为99.7％、99.5％、91.2％、90.6％、90.5％、90.1％、89.5％、86.5％、81.9％、81.7％、72.0％和70.6％.陆川猪与杜长大猪的遗传距离最近,与狼的遗传距离最远.陆川猪和杜长大猪的Nrf2蛋白都由561个氨基酸组成,且以丝氨酸含量最高,占比12.5％,色氨酸含量最低,仅占0.4％,均具有较强的亲水性.在Nrf2蛋白二级结构中,杜长大猪Nrf2蛋白的无规则卷曲占57.75％,α-螺旋占34.05％,延伸链占5.35％,β-转角占2.85％;陆川猪Nrf2蛋白的无规则卷曲占57.93％,α-螺旋占33.51％,延伸链占6.06％,β-转角占2.50％.150日龄陆川猪背最长肌中Nrf2基因相对表达量显著高于同日龄杜长大猪背最长肌中Nrf2基因的相对表达量(P<0.05);且陆川猪Nrf2蛋白表达量极显著高于同日龄杜长大猪背最长肌中Nrf2蛋白表达量(P<0.01).[结论]成功克隆陆川猪和杜长大猪Nrf2基因CDS序列,陆川猪背最长肌中Nrf2基因表达量显著高于同日龄杜长大猪,推测陆川猪肌肉具有比杜长大猪更加优良的抗氧化性能.
基金项目
国家自然科学基金(31760672)
广西自然科学基金(2022GXNSFAA035525)
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