南方农业学报2022，Vol.53Issue(4) ：969-976.DOI:10.3969/j.issn.2095-1191.2022.04.009

F3代香苏杂交猪DKK1基因多态性与生长性状的关联性

Correlation analysis of DKK1 gene polymorphism and growth traits of F3 generation Xiangsu hybrid pigs

许家利 许厚强 阮涌 赵佳福 倪萌萌 孙金魁 石鹏飞
南方农业学报2022，Vol.53Issue(4) ：969-976.DOI:10.3969/j.issn.2095-1191.2022.04.009
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F3代香苏杂交猪DKK1基因多态性与生长性状的关联性

Correlation analysis of DKK1 gene polymorphism and growth traits of F3 generation Xiangsu hybrid pigs

许家利 1许厚强 1阮涌 1赵佳福 1倪萌萌 1孙金魁 1石鹏飞1
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作者信息

  • 1. 贵州大学动物科学学院/高原山地动物遗传育种与繁殖教育部重点实验室/贵州省动物遗传育种与繁殖重点实验室,贵州贵阳 550025
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摘要

[目的]筛选出F3代香苏杂交猪Dickkopf-1基因(DKKI)的单核苷酸多态性位点(SNPs),并分析基因多态性与生长性状的关联性,为培育香苏杂交猪新品系提供参考依据,同时为深入研究DKK1基因生物学功能打下基础.[方法]通过DNA混池测序的方法对164头F3代香苏杂交猪群体DKK1基因进行SNPs鉴定,采用Excel 2017计算不同基因型的基因频率、基因型频率、遗传纯合度(Ho)、期望杂合度(He)、有效等位基因数(Ne)及多态信息含量(PIC),以卡方(c2)检验分析基因型是否处于Hardy-Weinberg平衡状态,并在此基础上分析F3代香苏杂交猪SNPs位点与生长性状的关联性.[结果]在F3代香苏杂交猪DKK1基因的Exon-3,4区域发现6个SNPs位点,分别是A2010T、G2012C、C2014T、A2040C、C2042A和G2044C.6个SNPs位点的Ho均高于He,其中,A2010T、G2012C、A2040C、C2042A和G2044C等5个SNPs位点的PIC处于中度多态水平,C2014T位点的PIC则处于低度多态水平.c2检验结果表明,仅C2042A位点处于Hardy-Weinberg极度不平衡状态(P<0.01),其他5个SNPs位点(A2010T、G2012C、C2014T、A2040C和G2044C)均处于Hardy-Weinberg平衡状态(P>0.05).关联分析结果表明,F3代香苏杂交猪DKK1基因A2010T、G2012C、C2014T、A2040C和G2044C位点的不同基因型在体高、胸围、管围、胸深和腿臀围方面表现出差异显著(P<0.05)或极显著(P<0.01).[结论]F3代香苏杂交猪DKK1基因A2010T、G2012C、C2014T、A2040C和G2044C位点不同基因型与体高、胸围、管围、胸深和腿臀围呈显著或极显著相关,可作为培育新品系的主效候选基因或与主基因紧密连锁的分子标记.

关键词

香苏杂交猪/DKK1基因/单核苷酸多态性位点(SNPs)/生长性状/关联性

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基金项目

贵州省科技计划(黔科合服企[2018]4007002号)

贵州省农业重大产业科学研究攻关项目(黔教合KY字[2019]011号)

出版年

2022
南方农业学报
广西壮族自治区农业科学院

南方农业学报

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子：0.83
ISSN：2095-1191
被引量1
参考文献量13
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