南方农业学报2022,Vol.53Issue(9) :2537-2546.DOI:10.3969/j.issn.2095-1191.2022.09.016

茶树Whirly基因家族的鉴定与表达分析

Identification and expression analysis of Whirly gene families in Camellia sinensis(L.)O. Kuntze

张续周 周艳华 王悦燕 李波 王缓 郑仪倩 王玉 郎旭旭 钱文俊
南方农业学报2022,Vol.53Issue(9) :2537-2546.DOI:10.3969/j.issn.2095-1191.2022.09.016

茶树Whirly基因家族的鉴定与表达分析

Identification and expression analysis of Whirly gene families in Camellia sinensis(L.)O. Kuntze

张续周 1周艳华 1王悦燕 2李波 3王缓 3郑仪倩 3王玉 3郎旭旭 3钱文俊3
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作者信息

  • 1. 青岛职业技术学院,山东青岛 266555
  • 2. 山东省海阳市科学技术局,山东烟台 265100
  • 3. 青岛农业大学园艺学院,山东青岛 266109
  • 折叠

摘要

[目的]对茶树Whirly基因家族成员进行鉴定及表达分析,为进一步探究Whirly基因家族在茶树生长发育和逆境响应的作用机理提供参考.[方法]以茶树品种北茶36、龙井43和大面白的叶片为材料,基于Whirly基因家族的保守结构特征,从茶树基因组鉴定CsWhys基因家族成员,利用生物信息学软件对其进行可视化分析,并对组织特异性和时空表达模式分析.[结果]从舒茶早茶树基因组中鉴定获得2个CsWhy基因,命名为CsWhy1(XP_028085682.1)和CsWhy2(XP_028102803.1).系统进化树分析结果显示CsWhy1和CsWhy2蛋白分别与已知的定位于叶绿体和线粒体的Whirly蛋白聚为一类.CsWhys基因启动子区域富含激素、胁迫和MYB转录因子结合位点等顺式作用元件,种类呈多样性.组织表达特性分析显示,CsWhy1在茶树叶片和芽中具有较高的表达丰度;CsWhy2则在茶树不同组织中均具有较高的表达丰度.时空表达模式分析结果发现,CsWhys的表达在不同时间点受低温、干旱、ABA、GA和H2O2处理诱导上调.冷驯化条件下,CsWhy1在抗寒品种龙井43和不抗寒品种大面白中呈现相反的表达模式,而CsWhy2在2个品种中均下调表达.[结论]茶树基因组中2个CsWhys基因具有Whirly基因家族的典型特征,茶树CsWhys基因的表达具有明显的组织特异性,推测CsWhys基因家族在茶树芽叶生长和抗逆过程中起发挥了重要调控作用.

关键词

茶树/Whirly基因/组织特异性/非生物胁迫/冷驯化/表达分析

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基金项目

出版年

2022
南方农业学报
广西壮族自治区农业科学院

南方农业学报

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子:0.83
ISSN:2095-1191
参考文献量12
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