南方农业学报2022,Vol.53Issue(9) :2547-2556.DOI:10.3969/j.issn.2095-1191.2022.09.017

基于TP-M13-SSR分子标记技术的133份薄皮甜瓜种质资源遗传多样性分析

Genetic diversity analysis of 133 pellicle melon germplasm resources based on TP-M13-SSR molecular marker technology

解华云 高崇敏 叶云峰 覃斯华 李桂芬 黄金艳 何毅 李天艳 柳唐镜 洪日新
南方农业学报2022,Vol.53Issue(9) :2547-2556.DOI:10.3969/j.issn.2095-1191.2022.09.017

基于TP-M13-SSR分子标记技术的133份薄皮甜瓜种质资源遗传多样性分析

Genetic diversity analysis of 133 pellicle melon germplasm resources based on TP-M13-SSR molecular marker technology

解华云 1高崇敏 2叶云峰 1覃斯华 1李桂芬 1黄金艳 1何毅 1李天艳 1柳唐镜 1洪日新1
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作者信息

  • 1. 广西农业科学院园艺研究所/广西西甜瓜工程技术研究中心,广西南宁 530007
  • 2. 广西农业职业技术大学,广西南宁 530007
  • 折叠

摘要

[目的]分析我国不同省(区)的薄皮甜瓜种质资源遗传多样性,为今后薄皮甜瓜的种质资源收集及遗传改良和高效利用提供理论依据.[方法]以来自我国不同省(区)的133份薄皮甜瓜种质为材料,从98对SSR引物中筛选得到12对多态性较高的引物,利用TP-M13-SSR分子标记技术对133份薄皮甜瓜种质材料进行遗传多样性分析,并根据Nei's遗传距离(D)进行聚类分析,以Structure软件的混合模型聚类法分析其群体遗传结构.[结果]利用12对引物从133份薄皮甜瓜种质材料中共扩增出的等位基因数(Na)为54个,平均每对引物4.5个,有效等位基因数(Ne)为1.120~2.234,平均为1.533;观测杂合度(Ho)为0.023~0.466,平均为0.217;期望杂合度(He)为0.107~0.552,平均为0.319,香农信息指数(I)范围为0.267~1.237,平均为0.642;各位点的多态性信息含量(PIC)为0.104~0.531,平均为0.295,大多数位点表现为中度多态性.聚类分析结果显示,133份薄皮甜瓜种质材料被分为两大类群,第Ⅰ类群为4份厚薄皮甜瓜材料,第Ⅱ类群为129份薄皮甜瓜材料.群体遗传结构分析结果显示,当K=4时,△K出现明显的峰值,说明133份薄皮甜瓜种质材料分为4个组群较合适;133份材料中大部分材料的Q值大于0.6.[结论]供试的12对SSR引物表现为中度多态性,需要用更多的分子标记才能有效鉴别薄皮甜瓜材料.133份薄皮甜瓜种质材料遗传结构较为单一,遗传多样性较低,可能存在同物异名的材料,今后应加强对遗传背景差异大、亲缘关系远的种质资源的发掘利用.

关键词

薄皮甜瓜/TP-M13-SSR/遗传多样性/聚类分析

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基金项目

出版年

2022
南方农业学报
广西壮族自治区农业科学院

南方农业学报

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子:0.83
ISSN:2095-1191
被引量2
参考文献量3
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