南方农业学报2023,Vol.54Issue(3) :681-690.DOI:10.3969/j.issn.2095-1191.2023.03.004

基于转录组测序分析白藜芦醇促进山羊肌内脂肪沉积的机制

Mechanism of resveratrol promoting intramuscular fat deposi-tion in goats based on transcriptome sequencing analysis

宋颖 张叁保 徐健健 邹剑伟 连子童 邹菊红 黄艳娜 蒋钦杨
南方农业学报2023,Vol.54Issue(3) :681-690.DOI:10.3969/j.issn.2095-1191.2023.03.004

基于转录组测序分析白藜芦醇促进山羊肌内脂肪沉积的机制

Mechanism of resveratrol promoting intramuscular fat deposi-tion in goats based on transcriptome sequencing analysis

宋颖 1张叁保 1徐健健 1邹剑伟 1连子童 1邹菊红 1黄艳娜 1蒋钦杨1
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作者信息

  • 1. 广西大学动物科学技术学院,广西南宁 530004
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摘要

[目的]基于转录组测序(RNA-Seq)分析白藜芦醇促进努比亚山羊肌内脂肪沉积的机制,以期找到白藜芦醇影响肌内脂肪沉积的候选基因及调控网络.[方法]采用转录组测序技术对饲料中添加600 mg/kg白藜芦醇组山羊的背最长肌和对照组山羊的背最长肌进行分析.利用edgeR软件进行差异基因(Differentially expressed genes,DEGs)筛选[Fold Change≥2,错误发现率(FDR)<0.05],并对DEGs进行GO功能注释和KEGG富集分析.实时荧光定量PCR(qRT-PCR)检测P13K-AKT信号通路关键基因及脂肪分化标志基因的表达.[结果]600 mg/kg白藜芦醇组山羊肌内脂肪含量极显著高于对照组(P<0.01,下同).RNA-Seq结果显示共筛选出399个DEGs,包括328个上调基因及71个下调基因.DEGs共注释到48个条目,主要包括细胞过程、单有机体过程、细胞、绑定和催化活性.KEGG通路富集分析发现,DEGs主要富集到252个通路,主要包括P13K-AKT信号通路、MAPK信号通路、AMPK信号通路等与脂肪代谢相关的通路,从中进一步筛选出可能参与肌内脂肪沉积的基因(IGFBP7和IRX3).qRT-PCR结果显示,试验组山羊背最长肌P13K-AKT信号通路关键基因(P13K、AKT和MTOR)和脂肪分化标志基因(PPARγ、FAS和CEBPα)的表达量极显著高于对照组.50 µmol/L RSV诱导肌细胞8d后发现,脂滴极显著多于对照组,P13K、AKT、MTOR、PPARγ、FAS和CEBPα的表达量极显著高于对照组.[结论]基于RNA-Seq分析白藜芦醇促进努比亚山羊肌内脂肪沉积的机制,结合其诱导肌细胞成脂分化,猜测白藜芦醇可能通过P13K-AKT信号通路促进努比亚山羊肌内脂肪的沉积.

关键词

转录组测序/白藜芦醇/山羊/肌内脂肪/P13K-AKT

Key words

transcriptome sequencing(RNA-Seq)/resveratrol/goat/intramuscular fat/P13K-AKT

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基金项目

国家重点研发计划(2021YFD1100100)

现代农业产业技术体系建设项目广西创新团队项目(2021YFD1100100)

Guangxi Innovation Team Construction Project of National Modern Agricultural Industry Technology System(nycytxgxcxtd-2021-09)

出版年

2023
南方农业学报
广西壮族自治区农业科学院

南方农业学报

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子:0.83
ISSN:2095-1191
参考文献量9
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