南方农业学报2023,Vol.54Issue(3) :704-714.DOI:10.3969/j.issn.2095-1191.2023.03.006

基于转录组测序分析枸杞多糖对免疫抑制雏鸡脾脏基因表达的影响

Effects of Lycium barbarum polysaccharide on genes expression in spleen of immunosuppressed chicks based on transcriptome sequencing

王建东 唐玉林 王敏 张宝锁 杨富强 高海慧 于洋 郭延生
南方农业学报2023,Vol.54Issue(3) :704-714.DOI:10.3969/j.issn.2095-1191.2023.03.006

基于转录组测序分析枸杞多糖对免疫抑制雏鸡脾脏基因表达的影响

Effects of Lycium barbarum polysaccharide on genes expression in spleen of immunosuppressed chicks based on transcriptome sequencing

王建东 1唐玉林 2王敏 3张宝锁 4杨富强 4高海慧 1于洋 1郭延生2
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作者信息

  • 1. 宁夏农林科学院动物科学研究所,宁夏银川 750002
  • 2. 宁夏大学农学院,宁夏银川 750021
  • 3. 宁夏银川市妇幼保健院,宁夏银川 750001
  • 4. 宁夏顺宝现代农业股份有限公司,宁夏吴忠 751600
  • 折叠

摘要

[目的]利用转录组测序技术分析枸杞多糖(LBP)对免疫抑制雏鸡脾脏基因表达的影响,挖掘LBP修复雏鸡免疫抑制的靶基因,为探究枸杞多糖对雏鸡免疫抑制的修复机制提供理论依据.[方法]将120羽7日龄海兰褐蛋鸡随机分成空白组(NC)、环磷酰胺(CTX)组(CY)和LBP组(CYLbGp),NC组肌注生理盐水,其余2组连续3d肌注80 mg/(kg·d)CTX造模,造模后通过测定血清中IL-2、IL-6和INF-γ含量对免疫抑制雏鸡模型进行验证.造模成功后在CYLbGp组饮水中加入5 mg/(kg·d)LBP,给药结束后采集脾脏进行转录组测序,以P<0.05和|log2 Fold change|≥1为条件筛选出差异表达基因(DEGs),并进行GO功能注释分析和KEGG信号通路富集分析,以探究枸杞多糖对免疫抑制的修复作用.[结果]共获得1049301886个Raw reads,对其进行质控、过滤后,共获得1032097278个Clean reads.CY组和NC组之间共有701个DEGs,CYLbGp组和CY组之间共有748个DEGs.GO功能注释显示,LBP干预后显著回调的DEGs主要与结合、细胞过程、生物调节及细胞组分等功能相关.KEGG信号通路富集结果显示,LBP干预后显著回调的DEGs主要与神经活性配体-受体相互作用和视黄醇代谢通路相关,筛选出所富集的通路中关键的DEGs为人毒蕈碱型胆碱受体M5基因(CHRM5)、烟碱型乙酰胆碱受体β4基因(CHRNB4)、代谢型型谷氨酸受体1基因(GRM1)、胆囊收缩素基因(CCK)、神经肽Y1受体基因(NPY1R)、细胞色素P450家族成员2C18基因(CYP2C18)、血管紧张素Ⅱ受体1基因(AGTR1)、细胞色素P450家族成员3A5基因(CYP3A5)、丝氨酸蛋白酶2(PRSS2)和神经紧张素基因(NTS).RT-qPCR结果与转录组学数据变化趋势基本一致,表明转录组数据有较高的可靠性.[结论]LBP修复雏鸡免疫抑制的作用机制可能与调节神经活性配体-受体相互作用和视黄醇代谢通路有关,其中CHRM5、CHRNB4、GRM1、CCK、NPY1R、CYP2C18、AGTR1、CYP3A5、PRSS2和NTS可作为LBP修复雏鸡免疫抑制的靶基因.

关键词

枸杞多糖/雏鸡/环磷酰胺/转录组学

Key words

Lycium barbarum polysaccharides/chicks/cyclophosphamide/transcriptomics

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基金项目

宁夏回族自治区自然科学基金重点项目(2020AAC02032)

出版年

2023
南方农业学报
广西壮族自治区农业科学院

南方农业学报

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子:0.83
ISSN:2095-1191
参考文献量16
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