南方农业学报2023,Vol.54Issue(5) :1397-1404.DOI:10.3969/j.issn.2095-1191.2023.05.012

甘薯块根内生固氮菌的分离鉴定和系统发育分析

Isolation,identification and phylogenetic analysis of endophytic nitrogen-fixing bacteria from sweet potato tuberous root

王崇 雷剑 靳晓杰 柴沙沙 邹语嫣 孙小琼 焦春海 杨新笋 王连军
南方农业学报2023,Vol.54Issue(5) :1397-1404.DOI:10.3969/j.issn.2095-1191.2023.05.012

甘薯块根内生固氮菌的分离鉴定和系统发育分析

Isolation,identification and phylogenetic analysis of endophytic nitrogen-fixing bacteria from sweet potato tuberous root

王崇 1雷剑 2靳晓杰 2柴沙沙 2邹语嫣 2孙小琼 3焦春海 2杨新笋 2王连军2
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作者信息

  • 1. 湖北省农业科学院粮食作物研究所/粮食作物种质创新与遗传改良湖北省重点实验室/农业农村部作物分子育种重点实验室,湖北武汉 430064;长江大学农学院,湖北荆州 434025
  • 2. 湖北省农业科学院粮食作物研究所/粮食作物种质创新与遗传改良湖北省重点实验室/农业农村部作物分子育种重点实验室,湖北武汉 430064
  • 3. 青海大学农牧学院,青海西宁 810016
  • 折叠

摘要

[目的]对甘薯块根内生固氮菌进行分子鉴定和多样性分析,并分析其菌群结构,为深入研究甘薯内生固氮菌的应用提供理论参考.[方法]以鄂薯11和鄂薯17为试验材料,采用无氮培养基筛选获得2个甘薯品种块根的内生固氮菌,根据16S rDNA基因序列分析对分离的内生固氮菌进行分类鉴定;进一步扩增nifH基因片段验证固氮菌;依据Shannon多样性指数、菌株相对分离率和相似性指数对甘薯块根内生固氮菌的菌群分布及多样性进行分析,并比较内生固氮菌菌群差异.[结果]从鄂薯11和鄂薯17块根中总共分离得到80株内生固氮菌,归属为1门1纲1目1科2属,包括普里斯特氏菌属(Priestia)和芽孢杆菌属(Bacillus),相对分离率分别为51.25%和48.75%;普里斯特氏菌属在鄂薯11和鄂薯17块根的相对分离率分别为51.11%和51.43%,芽孢杆菌属在鄂薯11和鄂薯17块根的相对分离率分别为48.89%和48.57%,2个甘薯品种块根中内生固氮菌的相对分离率变化差异小.2个甘薯品种块根内生固氮菌总Shan-non指数为0.6929,总均匀度指数为0.4803.鄂薯11和鄂薯17间的相似性指数为1,2个甘薯品种块根中的内生固氮菌属相同.系统发育进化树显示,从鄂薯11和鄂薯17中分离得到的内生固氮菌遗传多样性较低.[结论]从鄂薯11和鄂薯17块根中分离鉴定出80株内生固氮菌,归属于普里斯特氏菌属和芽孢杆菌属,2个品种间的内生固氮菌菌群构成无明显差异.

关键词

甘薯/nifH基因/内生固氮菌/多样性/分离鉴定/系统发育

Key words

sweet potato/nifH gene/endophytic nitrogen-fixing bacteria/diversity/isolation and identification/phylogeny

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基金项目

国家甘薯产业技术体系建设专项(CARS-10)

粮食作物种质创新与遗传改良湖北省重点实验室开放课题(2020lzjj07)

湖北省支持种业高质量发展资金旱粮作物优异种质资源挖掘创制及新品种培育项目(KT4)

出版年

2023
南方农业学报
广西壮族自治区农业科学院

南方农业学报

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子:0.83
ISSN:2095-1191
参考文献量24
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