南方农业学报2023,Vol.54Issue(7) :1933-1943.DOI:10.3969/j.issn.2095-1191.2023.07.005

长日照条件下2个热带玉米自交系的蛋白质组学分析

Proteomics analysis of two tropical maize inbred lines under long sunshine condition

罗文举 路雪萍 童伟杨 李亚娇 马培杰 陈泽辉 王小利
南方农业学报2023,Vol.54Issue(7) :1933-1943.DOI:10.3969/j.issn.2095-1191.2023.07.005

长日照条件下2个热带玉米自交系的蛋白质组学分析

Proteomics analysis of two tropical maize inbred lines under long sunshine condition

罗文举 1路雪萍 2童伟杨 2李亚娇 3马培杰 3陈泽辉 4王小利3
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作者信息

  • 1. 贵州大学动物科学学院,贵州贵阳 550025
  • 2. 贵州大学生命科学学院(农业生物工程研究院)/山地植物资源保护与种质创新教育部重点实验室,贵州贵阳 550025
  • 3. 贵州省农业科学院草业研究所,贵州贵阳 550006
  • 4. 贵州省农业科学院旱粮研究所,贵州贵阳 550006
  • 折叠

摘要

[目的]对长日照条件下2个热带玉米自交系进行蛋白质组学分析,为揭示玉米在长日照下的开花分子调控机制提供理论依据.[方法]以光敏型(FT32)和光钝型(FQR273)热带玉米自交系为材料,利用串联质谱标签(TMT)技术筛选差异蛋白,并对其进行GO功能注释及KEGG信号通路富集分析,构建蛋白间的相互作用网络.[结果]从长日照条件下FT32和FQR273热带玉米自交系4叶期叶片样品鉴定出6082个有效蛋白,其中显著差异蛋白605个(107个上调表达,498个下调表达).605个差异蛋白注释到生物学过程、细胞组分和分子功能三大类,共79个条目,其中在生物学过程分类中,主要注释为翻译过程、谷胱甘肽代谢过程和蛋白质折叠;在细胞组分分类中,主要注释为膜整体组分、细胞质和叶绿体;在分子功能分类中,主要注释为ATP结合、金属离子结合和核糖体结构组成.有140个差异蛋白富集到13条KEGG信号通路,其中主要富集在次生代谢物生物合成、卟啉和叶绿素代谢和氨基酸生物合成.磷酸合成、核糖体代谢和翻译过程是玉米叶片在长日照条件下的关键途径.对被功能注释的196个蛋白进行归类和深入分析,根据生物学功能将其分为四大类,分别为活性氧(ROS)体内平衡(33个)、蛋白代谢(59个)、相关转移酶(25个)及其他功能(79个).[结论]在长日照条件下,光敏型FT32玉米相对于光钝型FQR273的ROS体内平衡能力和蛋白代谢相关蛋白及相关转移酶活性均呈下调表达,其他功能蛋白种类繁多且功能复杂,以不同的方式发挥作用.即在长日照条件下,光敏感FT32玉米叶片以核糖体代谢和翻译过程为主的调控系统,维持玉米正常生长.

关键词

热带玉米/长日照/串联质谱标签(TMT)/蛋白质组学/功能注释

Key words

tropical maize/long sunshine/tandem mass tag(TMT)/proteomics/function annotation

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基金项目

国家自然科学基金(32060394)

贵州省高层次创新型人才培养项目(黔科合平台人才[2018]5634-2)

贵州省农业科学院国基后补助项目(黔农科院国基后补助[2021]54)

贵州省农业科学院国基后补助项目(32060394)

Guizhou Project for Highlevel Innovative Talents Cultivation(QKHPTRC[2018]5634-2)

National Foundation Postsubsidy Project of Guizhou Academy of Agricultural Sciences(QNKYGJHBZ[2021]54)

National Foundation Postsubsidy Project of Guizhou Academy of Agricultural Sciences(QNKYGJHBZ[2021]33)

出版年

2023
南方农业学报
广西壮族自治区农业科学院

南方农业学报

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子:0.83
ISSN:2095-1191
被引量1
参考文献量13
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