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葡萄CBF4基因生物信息学及其对低温和硅酸钾响应分析

Bioinformatics of grape CBF4 gene and its response to low temperature and potassium silicate

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为探究葡萄CBF4基因的结构和表达特征,该研究以葡萄为材料,对葡萄CBF4基因进行生物信息学及低温和硅酸钾响应分析.结果表明:(1)CBF4蛋白定位在细胞核,有5个磷酸化位点和14个糖基化位点,无信号肽,是一个亲水的、脂溶性较差的膜外蛋白.二级结构以无规则卷曲为主,比例为56.88％.该蛋白包含一个AP2/EREBP结构域.(2)CBF4蛋白的多序列和系统进化分析表明酿酒葡萄与美洲葡萄的同源性最高、亲缘关系最近.(3)荧光定量PCR分析显示,低温胁迫后CBF4基因在葡萄叶片中表达水平上调,说明CBF4基因可能参与了葡萄叶片低温胁迫的响应.低温条件下,施加硅酸钾CBF4基因表达具有差异性,说明该基因在不同的葡萄组织中对硅酸钾的响应机制可能不同.以上结果为进一步研究葡萄CBF4基因的功能和机理奠定了基础.

张红梅、王旺田、张芮、杨科、王宝强、王翠玲

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甘肃农业大学 生命科学技术学院,甘肃省干旱生境作物学重点实验室,兰州 730070

葡萄 CBF4基因 低温胁迫 生物信息学 qRT-PCR

GNSW-2014-12315605525156900217JR5RA151

2022

10.11931/guihaia.gxzw202008042

广西植物
广西壮族自治区广西植物研究所,中国科学院广西植物研究所,广西植物学会

广西植物

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子：0.719
ISSN：1000-3142
年,卷(期)：2022.42(8)
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