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基于Ks分布的被子植物演化的时间尺度研究

Timescale of angiosperm evolution based on Ks distribution

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物种演化时间估算是生命演化研究的重要部分.近年来,许多研究发现由于不同基因和不同物种的进化速率差异显著,因此需要新的方法对进化事件发生时间进行重新估计.为了对被子植物演化时间的重新估计,该研究基于共享多倍化事件或共享分歧事件应该有共同同义突变率(Ks)峰值的理念,建立了基于基因组数据的进化速率矫正模型.结果表明:(1)对获取Ks分布三种常见方式进行比较分析,明确了通过提取共线性区块上Ks值的中位数的方式最优.(2)模拟了Ks值随时间累积系数(v)变化过程下的Ks分布,当假设v服从正态分布时,Ks分布出现了长尾现象.(3)将矫正方法应用到被子植物中,发现不同谱系的被子植物具有同步的辐射进化和适应性进化现象.并且,被子植物的进化速率虽然差异显著,但不同分支间的进化速率仍具有部分一致性,如木兰类植物进化速率最慢,真双子叶植物次之,单子叶植物进化速率最快.最终得到了相对可靠的物种同义突变率演化时间轴,为植物研究提供了系统发育和演化的支撑.

焦贝贝、王希胤

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华北理工大学 生命科学学院,河北 唐山063210

同义突变率(Ks)分布 被子植物 时间矫正 系统发育树 进化速率

32070669

2022

10.11931/guihaia.gxzw202203021

广西植物
广西壮族自治区广西植物研究所,中国科学院广西植物研究所,广西植物学会

广西植物

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子：0.719
ISSN：1000-3142
年,卷(期)：2022.42(10)
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