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萝卜泡菜细菌多样性的高通量测序分析

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本文基于Illumina平台的高通量测序,解析萝卜泡菜发酵液中亚硝酸盐浓度峰值期(第3d)和回落期(第7d)时细菌群落结构多样性.亚硝酸盐浓度峰值期和回落期样品中分别得到373和349个可操纵分类单元(OTU),分属于135和127个细菌属,且峰值期细菌群落丰富度、多样性以及均匀度指数均高于回落期.峰值期发酵液样品中以变形菌门细菌(相对丰度72.1%)最为优势,以Erwinia(45.0%)、Aeromonas(7.4%)、Pseudomonas(6.6%)、Shigella(6.0%)和Delftia(5.1%)为主要优势菌属.厚壁菌门(18.9%)为第二优势菌门,Lactococcus(10.5%)为其中的主要优势属.回落期发酵液样品中以厚壁菌门(84.0%)最为优势,优势属包括明Leuconostoc(27.5%)、Lactococcus(19.9%)、Weissella(19.2%)和Pediococcus(16.3%)等.而变形菌门相对丰度降为10.5%.结果表明伴随着亚硝酸盐浓度变化,萝卜泡菜发酵过程中细菌群落结构多样性也发生演替,与发酵液中亚硝酸盐的形成和降解密切相关.
The Analysis of Microbial Diversity in the Fermentation Broth of Pickled Radish Based on the High-throughput DNA Sequencing

朱琳、高凤、曾椿淋、俞冰倩、徐琴、刘轶斐、李雪、魏巍

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江苏大学食品与生物工程学院,江苏镇江212013

江苏大学农业装备工程学院,江苏镇江212013

萝卜泡菜 亚硝酸盐 高通量测序 细菌群落 可操纵分类单元

国家自然科学基金资助项目国家自然科学基金资助项目江苏省自然科学基金江苏省自然科学基金

3160006941503068BK20150496BK20150497

2018

现代食品科技
华南理工大学

现代食品科技

CSTPCD北大核心
影响因子:1.07
ISSN:1673-9078
年,卷(期):2018.34(2)
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