摘要
为了探究羊口疮病毒 114 蛋白作为羊口疮病毒多表位疫苗靶标的可能性,试验利用在线软件ABCpred预测 114 蛋白的优势B细胞表位,利用在线软件IEDB的MHC-Ⅰbinding server预测 114 蛋白的优势细胞毒性T细胞(CTL)表位;利用IEDB的MHC-Ⅱbinding server预测 114 蛋白的优势辅助性T细胞(HTL)表位;使用柔性短肽接头连接 114 蛋白的优势B、T细胞抗原表位,构建羊口疮病毒多表位疫苗.结果:羊口疮病毒 114 蛋白由 346 个氨基酸组成,包含 12 个优势B细胞抗原表位,分别位于 292~307 aa、264~279 aa、146~161 aa、331~346 aa、113~128 aa、298~313 aa、35~50 aa、324~339 aa、281~296 aa、162~177 aa、315~330 aa、204~219 aa;包含1 个优势CTL抗原表位,位于65~73 aa;包含5 个优势HTL抗原表位,分别位于69~83 aa、68~82 aa、70~84 aa、48~62 aa、284~298 aa;构建了基于114 蛋白的优势抗原表位的羊口疮病毒多表位疫苗.结论:羊口疮病毒 114 蛋白包含多个优势B细胞和T细胞抗原表位,可作为羊口疮病毒多表位疫苗的候选靶标,具有诱导强烈体液免疫与细胞免疫反应的可能性.
基金项目
贵州大学大学生"SRT"计划项目(贵大SRT字[2022]088)
贵州省科学技术基金(自然科学)(黔科合基础-ZK[2022]一般093)